More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4033 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2977  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  72.65 
 
 		 607 aa  899    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2143  hypothetical protein  71.74 
 
 		 607 aa  860    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.941743  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0089  putative potassium transport flavoprotein  66.49 
 
 		 602 aa  773    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00322224 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4048  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  76.96 
 
 		 600 aa  944    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3323  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  76.79 
 
 		 600 aa  942    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4157  monooxygenase protein, putative  72.67 
 
 		 599 aa  870    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316237  normal  0.900537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3171  flavin-containing monooxygenase FMO  74.46 
 
 		 600 aa  915    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2961  putative potassium transport flavoprotein  75.63 
 
 		 600 aa  937    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0619  putative potassium transport flavoprotein  69.08 
 
 		 611 aa  838    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7650  flavin-containing monooxygenase  83.33 
 
 		 600 aa  1035    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611149  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0617  hypothetical protein  71.83 
 
 		 612 aa  854    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21240  predicted flavoprotein involved in K+ transport  68.86 
 
 		 607 aa  833    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284302  normal  0.2026 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3024  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  70.09 
 
 		 600 aa  827    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0126  hypothetical protein  70.97 
 
 		 567 aa  780    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.622475  normal  0.638978 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3575  hypothetical protein  79.89 
 
 		 600 aa  894    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.656903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0624  hypothetical protein  71.83 
 
 		 633 aa  853    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2407  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  66.89 
 
 		 620 aa  769    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175557  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1943  flavin-containing monooxygenase, putative  70.3 
 
 		 615 aa  827    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4033  putative monooxygenase protein  100 
 
 		 600 aa  1240    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0879  flavin-containing monooxygenase FMO  64.66 
 
 		 596 aa  770    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.191041  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4391  putative potassium transport flavoprotein  62.9 
 
 		 598 aa  773    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0076  putative potassium transport flavoprotein  70.6 
 
 		 600 aa  836    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1896  putative potassium transport flavoprotein  63.84 
 
 		 609 aa  786    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2958  flavin-containing monooxygenase, putative  72.62 
 
 		 600 aa  884    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0637  hypothetical protein  71.83 
 
 		 633 aa  853    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2511  putative monooxygenase protein  75.42 
 
 		 600 aa  941    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2542  monooxygenase protein, putative  68.83 
 
 		 603 aa  827    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0787  hypothetical protein  71.67 
 
 		 610 aa  872    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  52.18 
 
 		 573 aa  581  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08351  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  43.37 
 
 		 614 aa  449  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01611  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  40.6 
 
 		 629 aa  419  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0641774 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  38.09 
 
 		 640 aa  395  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01129  conserved hypothetical protein  36.77 
 
 		 556 aa  344  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00253051  normal  0.734558 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11089  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11650)  34.64 
 
 		 624 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00144907  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  34.02 
 
 		 601 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  35.27 
 
 		 648 aa  315  9.999999999999999e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  31.98 
 
 		 637 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 		 610 aa  283  9e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.418882 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00586  conserved hypothetical protein  25.88 
 
 		 536 aa  141  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.793927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  26.18 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4542  putative flavoprotein involved in K+ transport  35.71 
 
 		 207 aa  125  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 378 aa  97.4  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.97 
 
 		 372 aa  97.4  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 382 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 382 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.22 
 
 		 348 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 439 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  30.21 
 
 		 439 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 382 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  30.21 
 
 		 439 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  28.79 
 
 		 347 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  29.01 
 
 		 347 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  29.46 
 
 		 347 aa  93.6  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  29.46 
 
 		 347 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  29.46 
 
 		 347 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.5 
 
 		 362 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  29.46 
 
 		 347 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 		 369 aa  92.8  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.19 
 
 		 362 aa  92.8  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  25.6 
 
 		 407 aa  92.8  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  27 
 
 		 371 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.63 
 
 		 348 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.34 
 
 		 381 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.07 
 
 		 427 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  28.65 
 
 		 439 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.05 
 
 		 381 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.24 
 
 		 349 aa  88.6  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.69 
 
 		 399 aa  88.6  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.05 
 
 		 381 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  30.22 
 
 		 344 aa  88.2  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  27.97 
 
 		 347 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  29.05 
 
 		 432 aa  87  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.26 
 
 		 377 aa  87  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.89 
 
 		 361 aa  87  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  29.74 
 
 		 419 aa  86.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  22.16 
 
 		 558 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 642 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 642 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.55 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  29.28 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  28.14 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  29.02 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  29.07 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  29.02 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  29.79 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  23.86 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.63 
 
 		 816 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  27.95 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.21 
 
 		 504 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 449 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  27.94 
 
 		 609 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  28.28 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.27 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.13 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.36 
 
 		 816 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  26.13 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>