35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1667 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  100 
 
 		 507 aa  1033    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  47.03 
 
 		 435 aa  286  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  36.21 
 
 		 426 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  34.58 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  45.3 
 
 		 187 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  43.65 
 
 		 188 aa  123  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  44.2 
 
 		 187 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  38.14 
 
 		 229 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  39.23 
 
 		 226 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  28.44 
 
 		 305 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  37.99 
 
 		 224 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  39.33 
 
 		 211 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  42.05 
 
 		 193 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  41.04 
 
 		 202 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  39.47 
 
 		 201 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  37.08 
 
 		 216 aa  101  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  39.47 
 
 		 201 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  33.16 
 
 		 206 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  32.99 
 
 		 208 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1622  hypothetical protein  32.26 
 
 		 304 aa  94.7  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  39.04 
 
 		 194 aa  94.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  35.16 
 
 		 186 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1554  hypothetical protein  34.58 
 
 		 750 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  34.01 
 
 		 208 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  35.36 
 
 		 190 aa  87  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3640  ParB-like nuclease  25.9 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3576  adenine methylase  30.22 
 
 		 208 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000695706 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1143  adenine methylase  28.57 
 
 		 200 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0265355  hitchhiker  1.9630399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3316  hypothetical protein  44.05 
 
 		 168 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  25.41 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1616  MT-A70 family protein  31.02 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57562  activator of IME1 Predicted N6-adenine RNA methylase IME4  28.25 
 
 		 531 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7351  MT-A70 family protein  35.77 
 
 		 130 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03860  mRNA methyltransferase, putative  26.21 
 
 		 406 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0501  haemagglutinin associated protein  22.88 
 
 		 230 aa  43.5  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0486042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>