51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1515 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  67.51 
 
 		 513 aa  665    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  67.51 
 
 		 511 aa  665    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  77.62 
 
 		 504 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  75.05 
 
 		 526 aa  768    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  100 
 
 		 504 aa  1008    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  68.05 
 
 		 514 aa  664    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  77.34 
 
 		 503 aa  781    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  65.05 
 
 		 511 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  59.84 
 
 		 500 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  58.86 
 
 		 500 aa  551  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  59.48 
 
 		 507 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  58.86 
 
 		 499 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  59.02 
 
 		 499 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  60.32 
 
 		 516 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  59.6 
 
 		 504 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  60.28 
 
 		 498 aa  546  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  57.66 
 
 		 498 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  59.92 
 
 		 506 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  59.18 
 
 		 490 aa  543  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  60.56 
 
 		 510 aa  538  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  57.86 
 
 		 502 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  60.65 
 
 		 520 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  58.48 
 
 		 498 aa  514  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  55.28 
 
 		 492 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  55.83 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  29.53 
 
 		 537 aa  97.4  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  27.76 
 
 		 744 aa  63.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  22.81 
 
 		 250 aa  57  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  27.52 
 
 		 595 aa  57  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  24.28 
 
 		 655 aa  54.7  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  27.33 
 
 		 628 aa  54.3  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  28.31 
 
 		 524 aa  52  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  26.16 
 
 		 659 aa  51.2  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  27.81 
 
 		 554 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  27.81 
 
 		 554 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  28.65 
 
 		 574 aa  48.5  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  25.42 
 
 		 580 aa  48.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  34.68 
 
 		 572 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  23.48 
 
 		 360 aa  47.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  28.97 
 
 		 550 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  24.91 
 
 		 608 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  20.83 
 
 		 560 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  24.91 
 
 		 608 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  38.89 
 
 		 582 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  28.41 
 
 		 611 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  28.21 
 
 		 523 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  27.53 
 
 		 608 aa  44.3  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  25.64 
 
 		 524 aa  44.3  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  33.8 
 
 		 579 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  26.85 
 
 		 581 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  27.94 
 
 		 603 aa  43.5  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>