29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2278 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  100 
 
 		 109 aa  210  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  55.1 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  44.76 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  45.45 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  44.32 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  38.46 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  53.76 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  42.7 
 
 		 188 aa  67  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  43.33 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  43.96 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  40.45 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  40.45 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  43.48 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  40.45 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  46.67 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  41.94 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  38.71 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  38.04 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  45.74 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  42.27 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  37.36 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  31.91 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  34.02 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  28.74 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  35.62 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  30.48 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2953  hypothetical protein  44.19 
 
 		 116 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  32.61 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>