213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0673 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
184 aa  366  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  76.63 
 
 
185 aa  262  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  60.67 
 
 
183 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  61.8 
 
 
242 aa  222  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  60.11 
 
 
183 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  59.34 
 
 
188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  60.11 
 
 
183 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  60.11 
 
 
183 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  60.11 
 
 
183 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  61.8 
 
 
190 aa  215  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  61.8 
 
 
190 aa  215  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  61.8 
 
 
191 aa  215  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  59.22 
 
 
189 aa  216  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  61.8 
 
 
191 aa  215  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  61.8 
 
 
187 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  61.8 
 
 
190 aa  215  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  61.8 
 
 
191 aa  215  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  60.11 
 
 
184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  57.38 
 
 
184 aa  214  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.87 
 
 
183 aa  214  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  60.67 
 
 
183 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.92 
 
 
187 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  58.99 
 
 
191 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  58.24 
 
 
191 aa  209  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  57.63 
 
 
194 aa  208  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  57.87 
 
 
192 aa  208  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  57.92 
 
 
185 aa  208  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  56.83 
 
 
185 aa  208  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  56.83 
 
 
185 aa  208  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  59.22 
 
 
184 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  56.98 
 
 
184 aa  204  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  59.12 
 
 
183 aa  202  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.98 
 
 
190 aa  201  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0063  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.8 
 
 
190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.35 
 
 
190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.24 
 
 
196 aa  194  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.22 
 
 
189 aa  193  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.1 
 
 
185 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  58.43 
 
 
181 aa  190  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0054  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.14 
 
 
202 aa  190  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0098  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.43 
 
 
198 aa  190  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0942  ATP--cobalamin adenosyltransferase  57.98 
 
 
191 aa  189  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.09 
 
 
197 aa  186  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
189 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0113  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.17 
 
 
189 aa  180  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1478  cobalamin adenosyltransferase  50.53 
 
 
192 aa  176  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0485137  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3773  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  58.7 
 
 
192 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0185512 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.65 
 
 
185 aa  175  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.38 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.94 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  47.89 
 
 
192 aa  167  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  47.89 
 
 
192 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50 
 
 
195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
190 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.37 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.52 
 
 
192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  48.92 
 
 
192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
195 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.37 
 
 
196 aa  161  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  41.9 
 
 
214 aa  161  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
192 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.9 
 
 
214 aa  160  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1498  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.06 
 
 
173 aa  160  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.576361  normal  0.890005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.52 
 
 
194 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50 
 
 
186 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.27 
 
 
192 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4375  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.59 
 
 
188 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.89 
 
 
192 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
190 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.55 
 
 
191 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.52 
 
 
191 aa  159  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.35 
 
 
192 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.8 
 
 
190 aa  158  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.69 
 
 
203 aa  158  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
189 aa  158  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1264  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.56 
 
 
203 aa  158  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.144531 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.21 
 
 
191 aa  158  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.21 
 
 
190 aa  157  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1349  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.9 
 
 
188 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
190 aa  157  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0935  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.62 
 
 
191 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.05 
 
 
178 aa  156  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.42 
 
 
198 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  49.74 
 
 
190 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
193 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.32 
 
 
198 aa  154  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.52 
 
 
197 aa  154  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  49.21 
 
 
190 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  48.17 
 
 
190 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0903  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.37 
 
 
196 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254406  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.39 
 
 
192 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.87 
 
 
191 aa  152  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
190 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0956  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.07 
 
 
188 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.57 
 
 
198 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.88 
 
 
192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.48 
 
 
187 aa  150  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.17 
 
 
190 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>