25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5290 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  100 
 
 
117 aa  244  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  35.87 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4152  hypothetical protein  35.96 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337445  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  34.44 
 
 
127 aa  57.8  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  32.22 
 
 
127 aa  53.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  33.33 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  33 
 
 
746 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  32.98 
 
 
133 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  31.63 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  30.38 
 
 
741 aa  48.9  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  33.75 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  32.94 
 
 
745 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  29.17 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  33.33 
 
 
745 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  31.87 
 
 
316 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  29.59 
 
 
190 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  34.07 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  27.55 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  31.33 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  29.03 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  26.53 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  28.57 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  27.59 
 
 
175 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  27.55 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  34.57 
 
 
215 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>