222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4419 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4419  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  100 
 
 
217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  34.93 
 
 
238 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  31.73 
 
 
223 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1754  deoxyribose-phosphate aldolase  31.73 
 
 
223 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000633467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1732  deoxyribose-phosphate aldolase  31.73 
 
 
223 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1703  deoxyribose-phosphate aldolase  31.73 
 
 
223 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000427517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1892  deoxyribose-phosphate aldolase  31.73 
 
 
223 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1927  deoxyribose-phosphate aldolase  31.73 
 
 
223 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03965e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1975  deoxyribose-phosphate aldolase  31.73 
 
 
223 aa  101  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2002  deoxyribose-phosphate aldolase  31.25 
 
 
223 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000046318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1057  deoxyribose-phosphate aldolase  33.18 
 
 
233 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3451  deoxyribose-phosphate aldolase  31.25 
 
 
223 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000347492  hitchhiker  7.10453e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  32.06 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1895  deoxyribose-phosphate aldolase  31.25 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  30.29 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1301  deoxyribose-phosphate aldolase  31.25 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1345  deoxyribose-phosphate aldolase  33.01 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532359  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1529  deoxyribose-phosphate aldolase  30.48 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.24647  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08130  deoxyribose-phosphate aldolase  33.71 
 
 
269 aa  96.3  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0152  deoxyribose-phosphate aldolase  39.52 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1248  deoxyribose-phosphate aldolase  29.19 
 
 
247 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.747393  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  30.14 
 
 
227 aa  95.5  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7285  deoxyribose-phosphate aldolase  30.24 
 
 
215 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2706  deoxyribose-phosphate aldolase  29.47 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3950  deoxyribose-phosphate aldolase  31.6 
 
 
219 aa  94.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  29.86 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  29.72 
 
 
220 aa  94  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  30.33 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0036  deoxyribose-phosphate aldolase  29.67 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000477173  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0689  deoxyribose-phosphate aldolase  31.68 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  27.88 
 
 
216 aa  89  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1538  deoxyribose-phosphate aldolase  30.23 
 
 
212 aa  88.6  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.539113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  29.73 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  28.77 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0124  deoxyribose-phosphate aldolase  32.7 
 
 
220 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0129  deoxyribose-phosphate aldolase  32.7 
 
 
220 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  31.53 
 
 
317 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  28.44 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1525  deoxyribose-phosphate aldolase  37.82 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0114  deoxyribose-phosphate aldolase  28.71 
 
 
221 aa  85.9  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  29.05 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0134  deoxyribose-phosphate aldolase  29.81 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2818  deoxyribose-phosphate aldolase  33.88 
 
 
239 aa  85.5  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.964115  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1434  deoxyribose-phosphate aldolase  32.92 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  29.72 
 
 
221 aa  84.7  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  31.85 
 
 
221 aa  84  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05590  deoxyribose-phosphate aldolase  29.17 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2538  deoxyribose-phosphate aldolase  28.84 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4274  deoxyribose-phosphate aldolase  29.86 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  31.13 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  29.94 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1583  deoxyribose-phosphate aldolase  29.91 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1239  deoxyribose-phosphate aldolase  31.6 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0688  deoxyribose-phosphate aldolase  32.28 
 
 
260 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.336126 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2173  deoxyribose-phosphate aldolase  35.22 
 
 
220 aa  82  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2211  deoxyribose-phosphate aldolase  35.22 
 
 
220 aa  82  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5921  deoxyribose-phosphate aldolase  31.16 
 
 
256 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3216  deoxyribose-phosphate aldolase  28.57 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0832  deoxyribose-phosphate aldolase  31.4 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1003  deoxyribose-phosphate aldolase  27.56 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2967  deoxyribose-phosphate aldolase  29.63 
 
 
233 aa  79  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0574826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0730  deoxyribose-phosphate aldolase  30.56 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151995  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0243  deoxyribose-phosphate aldolase  30.67 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.156632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  26.7 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0160558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  31.31 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0983  deoxyribose-phosphate aldolase  32.21 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231215  normal  0.0688357 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1452  deoxyribose-phosphate aldolase  32.3 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  28.22 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2070  deoxyribose-phosphate aldolase  29.09 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.661265  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2014  deoxyribose-phosphate aldolase  28.65 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25660  deoxyribose-phosphate aldolase  33.14 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107736  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1388  deoxyribose-phosphate aldolase  32.26 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0977  deoxyribose-phosphate aldolase  29.38 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.593139 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0009  deoxyribose-phosphate aldolase  29.3 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000986742  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  31.31 
 
 
238 aa  74.7  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.789001 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0572  deoxyribose-phosphate aldolase  31.28 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  25.82 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  28.19 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  26.11 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  30.05 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  29.17 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  24.65 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1745  deoxyribose-phosphate aldolase  33.12 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4728  deoxyribose-phosphate aldolase  28.3 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  29.41 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1524  deoxyribose-phosphate aldolase  32.52 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1266  deoxyribose-phosphate aldolase  30.43 
 
 
409 aa  72  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0916741  normal  0.0813164 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2024  deoxyribose-phosphate aldolase  28.88 
 
 
224 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  31.41 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  31.41 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2321  deoxyribose-phosphate aldolase  25.99 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000020157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1560  deoxyribose-phosphate aldolase  29.72 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5350  deoxyribose-phosphate aldolase  27.45 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  29.03 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  29.22 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  29.05 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  27.32 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3526  deoxyribose-phosphate aldolase  27.49 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  29.52 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2591  deoxyribose-phosphate aldolase  27.88 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>