249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1560 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1560  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 
222 aa  448  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  46.95 
 
 
224 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2024  deoxyribose-phosphate aldolase  46.48 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  44.6 
 
 
222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  41.98 
 
 
216 aa  175  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1345  deoxyribose-phosphate aldolase  41.74 
 
 
223 aa  174  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532359  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  43.87 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  43.19 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  41.67 
 
 
233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  44.39 
 
 
224 aa  172  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0152  deoxyribose-phosphate aldolase  44.34 
 
 
215 aa  171  6.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  43.12 
 
 
226 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1434  deoxyribose-phosphate aldolase  42.86 
 
 
229 aa  166  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3408  deoxyribose-phosphate aldolase  39.91 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00715959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0009  deoxyribose-phosphate aldolase  42.06 
 
 
249 aa  164  9e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000986742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2002  deoxyribose-phosphate aldolase  42.45 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000046318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  41.04 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1754  deoxyribose-phosphate aldolase  41.51 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000633467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1732  deoxyribose-phosphate aldolase  41.51 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1703  deoxyribose-phosphate aldolase  41.51 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000427517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1927  deoxyribose-phosphate aldolase  41.51 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03965e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1892  deoxyribose-phosphate aldolase  41.51 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1895  deoxyribose-phosphate aldolase  41.51 
 
 
223 aa  161  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1975  deoxyribose-phosphate aldolase  41.51 
 
 
223 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3451  deoxyribose-phosphate aldolase  41.51 
 
 
223 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000347492  hitchhiker  7.10453e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  41.04 
 
 
223 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1529  deoxyribose-phosphate aldolase  40.85 
 
 
220 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.24647  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  42.25 
 
 
221 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  41.67 
 
 
228 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0689  deoxyribose-phosphate aldolase  43.66 
 
 
215 aa  159  3e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  43.75 
 
 
223 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  38.99 
 
 
223 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0160558  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  42.86 
 
 
217 aa  159  5e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2706  deoxyribose-phosphate aldolase  41.12 
 
 
220 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  43.05 
 
 
235 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2600  deoxyribose-phosphate aldolase  41.1 
 
 
219 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4274  deoxyribose-phosphate aldolase  41.83 
 
 
218 aa  154  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1057  deoxyribose-phosphate aldolase  41.18 
 
 
233 aa  154  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3950  deoxyribose-phosphate aldolase  40.28 
 
 
219 aa  154  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  41.75 
 
 
220 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  37.56 
 
 
241 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1452  deoxyribose-phosphate aldolase  42.01 
 
 
220 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  42.59 
 
 
224 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7285  deoxyribose-phosphate aldolase  38.03 
 
 
215 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  37.61 
 
 
260 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  40.09 
 
 
217 aa  152  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0129  deoxyribose-phosphate aldolase  37.91 
 
 
220 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0124  deoxyribose-phosphate aldolase  37.91 
 
 
220 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2818  deoxyribose-phosphate aldolase  40.19 
 
 
239 aa  151  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.964115  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2211  deoxyribose-phosphate aldolase  37.74 
 
 
220 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  40.38 
 
 
224 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  41.43 
 
 
227 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2173  deoxyribose-phosphate aldolase  37.74 
 
 
220 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  37.56 
 
 
220 aa  149  5e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  37.27 
 
 
248 aa  148  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  40.67 
 
 
222 aa  148  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  42.52 
 
 
237 aa  148  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1266  deoxyribose-phosphate aldolase  40 
 
 
409 aa  148  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0916741  normal  0.0813164 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  38.94 
 
 
222 aa  147  9e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3216  deoxyribose-phosphate aldolase  41.12 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0243  deoxyribose-phosphate aldolase  39.71 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.156632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1239  deoxyribose-phosphate aldolase  39.17 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1745  deoxyribose-phosphate aldolase  37.74 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  38.43 
 
 
248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  37.09 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  38.43 
 
 
248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  37.27 
 
 
248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  39.72 
 
 
238 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0036  deoxyribose-phosphate aldolase  40.67 
 
 
222 aa  142  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000477173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  41.18 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1583  deoxyribose-phosphate aldolase  41.87 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1248  deoxyribose-phosphate aldolase  38.03 
 
 
247 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.747393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  37.91 
 
 
317 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0572  deoxyribose-phosphate aldolase  36.99 
 
 
235 aa  135  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.574105  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1301  deoxyribose-phosphate aldolase  38.03 
 
 
238 aa  135  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113978 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2070  deoxyribose-phosphate aldolase  39.22 
 
 
223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.661265  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4491  deoxyribose-phosphate aldolase  39.15 
 
 
226 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0730  deoxyribose-phosphate aldolase  37.2 
 
 
226 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151995  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05590  deoxyribose-phosphate aldolase  37.61 
 
 
229 aa  131  6.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1685  deoxyribose-phosphate aldolase  37.74 
 
 
222 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0166673  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl639  deoxyribose-phosphate aldolase  33.18 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0832  deoxyribose-phosphate aldolase  35.98 
 
 
236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2652  deoxyribose-phosphate aldolase  37.74 
 
 
223 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3719  deoxyribose-phosphate aldolase  37.26 
 
 
222 aa  126  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.485084  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2737  deoxyribose-phosphate aldolase  37.74 
 
 
223 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08130  deoxyribose-phosphate aldolase  36.68 
 
 
269 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1538  deoxyribose-phosphate aldolase  37.61 
 
 
212 aa  125  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.539113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1951  deoxyribose-phosphate aldolase  36.79 
 
 
222 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0763  deoxyribose-phosphate aldolase  36.11 
 
 
242 aa  124  9e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.503498  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6902  deoxyribose-phosphate aldolase  36.92 
 
 
226 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1632  deoxyribose-phosphate aldolase  38.21 
 
 
226 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101131  hitchhiker  0.000603292 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1556  deoxyribose-phosphate aldolase  37.26 
 
 
223 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2538  deoxyribose-phosphate aldolase  36.7 
 
 
223 aa  123  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0134  deoxyribose-phosphate aldolase  36.19 
 
 
213 aa  122  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2833  deoxyribose-phosphate aldolase  34.11 
 
 
231 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0559245 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04772  deoxyribose-phosphate aldolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06590)  37.21 
 
 
544 aa  121  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.153321  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3256  deoxyribose-phosphate aldolase  33.65 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0977  deoxyribose-phosphate aldolase  36.41 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.593139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2974  deoxyribose-phosphate aldolase  32.31 
 
 
241 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0983  deoxyribose-phosphate aldolase  35.05 
 
 
228 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231215  normal  0.0688357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>