254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1003 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1003  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 		 236 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  71.69 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.789001 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0832  deoxyribose-phosphate aldolase  64.22 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4728  deoxyribose-phosphate aldolase  66.5 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25660  deoxyribose-phosphate aldolase  63.44 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107736  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21200  deoxyribose-phosphate aldolase  63.21 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4162  deoxyribose-phosphate aldolase  64.98 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0688  deoxyribose-phosphate aldolase  54.95 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.336126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5921  deoxyribose-phosphate aldolase  53.18 
 
 		 256 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0639  deoxyribose-phosphate aldolase  58.26 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.0436626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0646  deoxyribose-phosphate aldolase  58.26 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0659  deoxyribose-phosphate aldolase  58.26 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.156443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0811  deoxyribose-phosphate aldolase  60.73 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10486  deoxyribose-phosphate aldolase  63.3 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.235574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1266  deoxyribose-phosphate aldolase  56.6 
 
 		 409 aa  205  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0916741  normal  0.0813164 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1529  deoxyribose-phosphate aldolase  49.08 
 
 		 220 aa  204  7e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.24647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0787  deoxyribose-phosphate aldolase  57.67 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0097  deoxyribose-phosphate aldolase  59.63 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  51.98 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  50.69 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  48.86 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1248  deoxyribose-phosphate aldolase  50.66 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.747393  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2024  deoxyribose-phosphate aldolase  48.4 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  49.76 
 
 		 223 aa  184  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  49.29 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  50.94 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05590  deoxyribose-phosphate aldolase  53.78 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3653  deoxyribose-phosphate aldolase  51.1 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1057  deoxyribose-phosphate aldolase  50.22 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2002  deoxyribose-phosphate aldolase  48.85 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000046318  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0129  deoxyribose-phosphate aldolase  46.26 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  42.47 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0124  deoxyribose-phosphate aldolase  46.26 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2600  deoxyribose-phosphate aldolase  52.78 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1754  deoxyribose-phosphate aldolase  48.82 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000633467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1732  deoxyribose-phosphate aldolase  48.82 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1703  deoxyribose-phosphate aldolase  48.82 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000427517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1892  deoxyribose-phosphate aldolase  48.82 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1927  deoxyribose-phosphate aldolase  48.82 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03965e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1895  deoxyribose-phosphate aldolase  48.58 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1975  deoxyribose-phosphate aldolase  48.82 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3451  deoxyribose-phosphate aldolase  48.58 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000347492  hitchhiker  7.10453e-17 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1538  deoxyribose-phosphate aldolase  48.1 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.539113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2211  deoxyribose-phosphate aldolase  46.67 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2173  deoxyribose-phosphate aldolase  46.67 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1745  deoxyribose-phosphate aldolase  46.08 
 
 		 220 aa  174  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1345  deoxyribose-phosphate aldolase  46.01 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532359  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  46.95 
 
 		 217 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0036  deoxyribose-phosphate aldolase  41.71 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000477173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  45.78 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  44.65 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  45.91 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  44.8 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  48.82 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  48.83 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  45.83 
 
 		 222 aa  168  7e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1301  deoxyribose-phosphate aldolase  49.56 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  43.78 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  39.15 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  45.54 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  46.51 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  46.23 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6902  deoxyribose-phosphate aldolase  49.54 
 
 		 226 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0152  deoxyribose-phosphate aldolase  42.25 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2706  deoxyribose-phosphate aldolase  47.89 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1951  deoxyribose-phosphate aldolase  44.2 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  43.13 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  46.23 
 
 		 248 aa  161  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1583  deoxyribose-phosphate aldolase  39.63 
 
 		 222 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  41.51 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1685  deoxyribose-phosphate aldolase  44.2 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0166673  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0009  deoxyribose-phosphate aldolase  41.4 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000986742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  39.81 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  45.24 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3719  deoxyribose-phosphate aldolase  42.53 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.485084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4491  deoxyribose-phosphate aldolase  46.73 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2818  deoxyribose-phosphate aldolase  45.96 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.964115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1452  deoxyribose-phosphate aldolase  41.01 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  43.52 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  40.19 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  43.13 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0160558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4274  deoxyribose-phosphate aldolase  44.6 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  40.47 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  44.8 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  43.19 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  40.57 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3002  deoxyribose-phosphate aldolase  46.67 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00170896 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2652  deoxyribose-phosphate aldolase  44.44 
 
 		 223 aa  151  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08130  deoxyribose-phosphate aldolase  44.44 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2737  deoxyribose-phosphate aldolase  44.44 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  44.19 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  43.72 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  38.5 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1556  deoxyribose-phosphate aldolase  43.98 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0243  deoxyribose-phosphate aldolase  43.27 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.156632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0730  deoxyribose-phosphate aldolase  44.17 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0977  deoxyribose-phosphate aldolase  44.08 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.593139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1525  deoxyribose-phosphate aldolase  44.35 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0134  deoxyribose-phosphate aldolase  44.81 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6286  deoxyribose-phosphate aldolase  49.11 
 
 		 226 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.576612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>