255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1505 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 
235 aa  471  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1345  deoxyribose-phosphate aldolase  49.55 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  47.49 
 
 
216 aa  214  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1434  deoxyribose-phosphate aldolase  47.32 
 
 
229 aa  209  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1057  deoxyribose-phosphate aldolase  50.88 
 
 
233 aa  208  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  51.38 
 
 
223 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  48.43 
 
 
221 aa  202  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1745  deoxyribose-phosphate aldolase  47.75 
 
 
220 aa  202  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  46.79 
 
 
222 aa  201  7e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  46.67 
 
 
223 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  43.24 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0160558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4274  deoxyribose-phosphate aldolase  49.33 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  46.05 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  45.78 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  45.78 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  47.09 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  46.26 
 
 
222 aa  196  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  46.58 
 
 
227 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1248  deoxyribose-phosphate aldolase  47.73 
 
 
247 aa  194  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.747393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2002  deoxyribose-phosphate aldolase  47.25 
 
 
223 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000046318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1754  deoxyribose-phosphate aldolase  46.22 
 
 
223 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000633467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1732  deoxyribose-phosphate aldolase  46.22 
 
 
223 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1703  deoxyribose-phosphate aldolase  46.22 
 
 
223 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000427517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1892  deoxyribose-phosphate aldolase  46.22 
 
 
223 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  44.14 
 
 
224 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1927  deoxyribose-phosphate aldolase  46.22 
 
 
223 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03965e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1975  deoxyribose-phosphate aldolase  46.22 
 
 
223 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1895  deoxyribose-phosphate aldolase  46.22 
 
 
223 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2024  deoxyribose-phosphate aldolase  43.24 
 
 
224 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3451  deoxyribose-phosphate aldolase  46.22 
 
 
223 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000347492  hitchhiker  7.10453e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  44.49 
 
 
226 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  47.06 
 
 
248 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  47.06 
 
 
248 aa  191  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  43.11 
 
 
260 aa  191  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0152  deoxyribose-phosphate aldolase  46.79 
 
 
215 aa  190  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  43.05 
 
 
217 aa  191  1e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  45.7 
 
 
223 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1239  deoxyribose-phosphate aldolase  44.34 
 
 
243 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  46.88 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1529  deoxyribose-phosphate aldolase  45 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.24647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2706  deoxyribose-phosphate aldolase  46.43 
 
 
220 aa  188  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  48.64 
 
 
237 aa  187  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1452  deoxyribose-phosphate aldolase  43.18 
 
 
220 aa  186  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  45.41 
 
 
248 aa  185  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  43.75 
 
 
220 aa  185  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  45.41 
 
 
248 aa  185  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3216  deoxyribose-phosphate aldolase  48.87 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0689  deoxyribose-phosphate aldolase  41.63 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  41.52 
 
 
222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1266  deoxyribose-phosphate aldolase  46.09 
 
 
409 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0916741  normal  0.0813164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2818  deoxyribose-phosphate aldolase  48.2 
 
 
239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.964115  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  42.73 
 
 
224 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3950  deoxyribose-phosphate aldolase  48.15 
 
 
219 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  40.61 
 
 
221 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2538  deoxyribose-phosphate aldolase  43.44 
 
 
223 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0036  deoxyribose-phosphate aldolase  39.04 
 
 
222 aa  179  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000477173  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  44.7 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0730  deoxyribose-phosphate aldolase  44.64 
 
 
226 aa  178  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151995  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0977  deoxyribose-phosphate aldolase  46.88 
 
 
228 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.593139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1301  deoxyribose-phosphate aldolase  44.8 
 
 
238 aa  178  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113978 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0009  deoxyribose-phosphate aldolase  42.36 
 
 
249 aa  178  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000986742  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0243  deoxyribose-phosphate aldolase  42.6 
 
 
241 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.156632  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0129  deoxyribose-phosphate aldolase  44.25 
 
 
220 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2211  deoxyribose-phosphate aldolase  44.64 
 
 
220 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0124  deoxyribose-phosphate aldolase  44.25 
 
 
220 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2173  deoxyribose-phosphate aldolase  44.64 
 
 
220 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  41.23 
 
 
224 aa  175  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  40.18 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  42.4 
 
 
241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  41.52 
 
 
231 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4491  deoxyribose-phosphate aldolase  43.56 
 
 
226 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0134  deoxyribose-phosphate aldolase  41.63 
 
 
213 aa  169  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  40.36 
 
 
220 aa  169  4e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1583  deoxyribose-phosphate aldolase  39.83 
 
 
222 aa  168  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3526  deoxyribose-phosphate aldolase  41.48 
 
 
256 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2591  deoxyribose-phosphate aldolase  41.67 
 
 
225 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2600  deoxyribose-phosphate aldolase  44.5 
 
 
219 aa  166  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2833  deoxyribose-phosphate aldolase  41.07 
 
 
231 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0559245 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1538  deoxyribose-phosphate aldolase  41.26 
 
 
212 aa  165  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.539113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3719  deoxyribose-phosphate aldolase  38.1 
 
 
222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.485084  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6902  deoxyribose-phosphate aldolase  42.24 
 
 
226 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3408  deoxyribose-phosphate aldolase  39.11 
 
 
224 aa  161  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00715959  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05590  deoxyribose-phosphate aldolase  43.11 
 
 
229 aa  160  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  42.4 
 
 
317 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3002  deoxyribose-phosphate aldolase  43.19 
 
 
231 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00170896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1525  deoxyribose-phosphate aldolase  43.1 
 
 
234 aa  159  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1685  deoxyribose-phosphate aldolase  42.01 
 
 
222 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0166673  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0688  deoxyribose-phosphate aldolase  42.86 
 
 
260 aa  158  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.336126 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1560  deoxyribose-phosphate aldolase  43.05 
 
 
222 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7285  deoxyribose-phosphate aldolase  40.91 
 
 
215 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2321  deoxyribose-phosphate aldolase  39.37 
 
 
221 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000020157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1951  deoxyribose-phosphate aldolase  41.55 
 
 
222 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2070  deoxyribose-phosphate aldolase  38.39 
 
 
223 aa  156  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.661265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1003  deoxyribose-phosphate aldolase  44.8 
 
 
236 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2737  deoxyribose-phosphate aldolase  40.71 
 
 
223 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5921  deoxyribose-phosphate aldolase  40.17 
 
 
256 aa  151  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2652  deoxyribose-phosphate aldolase  40.71 
 
 
223 aa  151  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1556  deoxyribose-phosphate aldolase  40.27 
 
 
223 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08130  deoxyribose-phosphate aldolase  38.91 
 
 
269 aa  149  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6286  deoxyribose-phosphate aldolase  42.67 
 
 
226 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.576612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>