255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5921 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5921  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 
256 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0688  deoxyribose-phosphate aldolase  76.45 
 
 
260 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.336126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1003  deoxyribose-phosphate aldolase  53.18 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  52.7 
 
 
238 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.789001 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0832  deoxyribose-phosphate aldolase  50.68 
 
 
236 aa  202  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0811  deoxyribose-phosphate aldolase  53.95 
 
 
225 aa  184  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25660  deoxyribose-phosphate aldolase  47.73 
 
 
240 aa  181  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107736  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0787  deoxyribose-phosphate aldolase  47.16 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1345  deoxyribose-phosphate aldolase  44.86 
 
 
223 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532359  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4162  deoxyribose-phosphate aldolase  50 
 
 
225 aa  175  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4728  deoxyribose-phosphate aldolase  47.25 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21200  deoxyribose-phosphate aldolase  49.77 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  44.7 
 
 
220 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  39.91 
 
 
222 aa  170  2e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0097  deoxyribose-phosphate aldolase  52.23 
 
 
225 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247733  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  44.84 
 
 
228 aa  168  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2024  deoxyribose-phosphate aldolase  41.67 
 
 
224 aa  168  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  41.67 
 
 
224 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  45.66 
 
 
227 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  47.51 
 
 
238 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1057  deoxyribose-phosphate aldolase  47.37 
 
 
233 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10486  deoxyribose-phosphate aldolase  51.33 
 
 
224 aa  165  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.235574  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1529  deoxyribose-phosphate aldolase  43.19 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.24647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3002  deoxyribose-phosphate aldolase  46.4 
 
 
231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00170896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  43.75 
 
 
233 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  43.87 
 
 
217 aa  163  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  46.12 
 
 
222 aa  162  6e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  44.69 
 
 
224 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  43.19 
 
 
223 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  44.5 
 
 
223 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4274  deoxyribose-phosphate aldolase  43.69 
 
 
218 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3653  deoxyribose-phosphate aldolase  45.22 
 
 
234 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  41.78 
 
 
223 aa  158  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1266  deoxyribose-phosphate aldolase  45.58 
 
 
409 aa  158  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0916741  normal  0.0813164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0646  deoxyribose-phosphate aldolase  48.46 
 
 
226 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  40.74 
 
 
224 aa  157  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1248  deoxyribose-phosphate aldolase  45.08 
 
 
247 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.747393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0659  deoxyribose-phosphate aldolase  48.46 
 
 
226 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.156443  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0639  deoxyribose-phosphate aldolase  48.46 
 
 
226 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.0436626 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08130  deoxyribose-phosphate aldolase  45.18 
 
 
269 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2002  deoxyribose-phosphate aldolase  43.19 
 
 
223 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000046318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  41.78 
 
 
226 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1754  deoxyribose-phosphate aldolase  42.72 
 
 
223 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000633467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1732  deoxyribose-phosphate aldolase  42.72 
 
 
223 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1703  deoxyribose-phosphate aldolase  42.72 
 
 
223 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000427517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1892  deoxyribose-phosphate aldolase  42.72 
 
 
223 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1927  deoxyribose-phosphate aldolase  42.72 
 
 
223 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03965e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1895  deoxyribose-phosphate aldolase  42.72 
 
 
223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1975  deoxyribose-phosphate aldolase  42.72 
 
 
223 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3451  deoxyribose-phosphate aldolase  42.72 
 
 
223 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000347492  hitchhiker  7.10453e-17 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1538  deoxyribose-phosphate aldolase  44.7 
 
 
212 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.539113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2706  deoxyribose-phosphate aldolase  45.79 
 
 
220 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  40.28 
 
 
219 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  42.25 
 
 
223 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  40.17 
 
 
235 aa  151  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  36.65 
 
 
231 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  39.73 
 
 
217 aa  150  2e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1745  deoxyribose-phosphate aldolase  41.23 
 
 
220 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  40.62 
 
 
260 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  39.91 
 
 
221 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2600  deoxyribose-phosphate aldolase  48.36 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  40.64 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  40.57 
 
 
220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0152  deoxyribose-phosphate aldolase  40.64 
 
 
215 aa  146  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3719  deoxyribose-phosphate aldolase  38.22 
 
 
222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.485084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  38.36 
 
 
223 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0160558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  39.91 
 
 
221 aa  145  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  35.98 
 
 
216 aa  145  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  42.17 
 
 
317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1239  deoxyribose-phosphate aldolase  39.47 
 
 
243 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3216  deoxyribose-phosphate aldolase  46.26 
 
 
220 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2211  deoxyribose-phosphate aldolase  40.72 
 
 
220 aa  145  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2173  deoxyribose-phosphate aldolase  40.72 
 
 
220 aa  145  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05590  deoxyribose-phosphate aldolase  41.56 
 
 
229 aa  144  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0129  deoxyribose-phosphate aldolase  39.91 
 
 
220 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  43.5 
 
 
237 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0124  deoxyribose-phosphate aldolase  39.91 
 
 
220 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  42.2 
 
 
248 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0036  deoxyribose-phosphate aldolase  35.19 
 
 
222 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000477173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1951  deoxyribose-phosphate aldolase  43.19 
 
 
222 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  37.79 
 
 
222 aa  142  6e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6902  deoxyribose-phosphate aldolase  45.5 
 
 
226 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  41.74 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl639  deoxyribose-phosphate aldolase  38.01 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4491  deoxyribose-phosphate aldolase  45.79 
 
 
226 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1685  deoxyribose-phosphate aldolase  43.66 
 
 
222 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0166673  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1452  deoxyribose-phosphate aldolase  41.51 
 
 
220 aa  140  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0689  deoxyribose-phosphate aldolase  39.35 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7285  deoxyribose-phosphate aldolase  38.97 
 
 
215 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0114  deoxyribose-phosphate aldolase  41.82 
 
 
221 aa  138  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0730  deoxyribose-phosphate aldolase  40.83 
 
 
226 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151995  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1301  deoxyribose-phosphate aldolase  45.33 
 
 
238 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113978 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  39.46 
 
 
224 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0572  deoxyribose-phosphate aldolase  41.52 
 
 
235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.574105  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04772  deoxyribose-phosphate aldolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06590)  39.83 
 
 
544 aa  136  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.153321  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  43.27 
 
 
248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3950  deoxyribose-phosphate aldolase  38.5 
 
 
219 aa  135  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  43.27 
 
 
248 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0134  deoxyribose-phosphate aldolase  42.59 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2591  deoxyribose-phosphate aldolase  39.29 
 
 
225 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>