254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1452 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1452  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 
220 aa  440  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  58.33 
 
 
221 aa  261  6.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  57.87 
 
 
222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  58.88 
 
 
217 aa  237  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  52.51 
 
 
223 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2706  deoxyribose-phosphate aldolase  53.27 
 
 
220 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  51.39 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1345  deoxyribose-phosphate aldolase  52.78 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532359  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1057  deoxyribose-phosphate aldolase  51.36 
 
 
233 aa  217  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1266  deoxyribose-phosphate aldolase  48.87 
 
 
409 aa  216  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0916741  normal  0.0813164 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  50.47 
 
 
223 aa  215  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0160558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  51.15 
 
 
223 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0152  deoxyribose-phosphate aldolase  55.02 
 
 
215 aa  214  5.9999999999999996e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0009  deoxyribose-phosphate aldolase  50.7 
 
 
249 aa  214  9e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000986742  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  52.75 
 
 
216 aa  211  7e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1538  deoxyribose-phosphate aldolase  53.3 
 
 
212 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.539113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2024  deoxyribose-phosphate aldolase  50.7 
 
 
224 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2600  deoxyribose-phosphate aldolase  49.55 
 
 
219 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  48.36 
 
 
219 aa  209  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  50.23 
 
 
224 aa  208  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  50.93 
 
 
221 aa  208  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3216  deoxyribose-phosphate aldolase  51.4 
 
 
220 aa  208  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  46.61 
 
 
222 aa  207  1e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1248  deoxyribose-phosphate aldolase  48.62 
 
 
247 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.747393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  48.83 
 
 
220 aa  206  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  52.58 
 
 
248 aa  206  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  52.11 
 
 
248 aa  205  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  48.4 
 
 
226 aa  204  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6902  deoxyribose-phosphate aldolase  50.69 
 
 
226 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  48.13 
 
 
224 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1529  deoxyribose-phosphate aldolase  47.2 
 
 
220 aa  202  4e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.24647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2002  deoxyribose-phosphate aldolase  49.06 
 
 
223 aa  201  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000046318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  47.53 
 
 
233 aa  201  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  50.7 
 
 
222 aa  201  7e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0689  deoxyribose-phosphate aldolase  47.37 
 
 
215 aa  201  7e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1583  deoxyribose-phosphate aldolase  46.48 
 
 
222 aa  201  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1745  deoxyribose-phosphate aldolase  47.96 
 
 
220 aa  201  8e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1927  deoxyribose-phosphate aldolase  48.11 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03965e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1975  deoxyribose-phosphate aldolase  48.11 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1754  deoxyribose-phosphate aldolase  48.11 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000633467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1732  deoxyribose-phosphate aldolase  48.11 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1703  deoxyribose-phosphate aldolase  48.11 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000427517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1892  deoxyribose-phosphate aldolase  48.11 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1895  deoxyribose-phosphate aldolase  48.11 
 
 
223 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3451  deoxyribose-phosphate aldolase  48.11 
 
 
223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000347492  hitchhiker  7.10453e-17 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  47.66 
 
 
224 aa  198  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  47.17 
 
 
223 aa  197  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2818  deoxyribose-phosphate aldolase  47.71 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.964115  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1685  deoxyribose-phosphate aldolase  51.18 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0166673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  47.06 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3408  deoxyribose-phosphate aldolase  48.6 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00715959  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0243  deoxyribose-phosphate aldolase  51.18 
 
 
241 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.156632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4491  deoxyribose-phosphate aldolase  49.77 
 
 
226 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  46.98 
 
 
228 aa  194  9e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  46.48 
 
 
217 aa  193  2e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1951  deoxyribose-phosphate aldolase  49.29 
 
 
222 aa  192  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  46.92 
 
 
238 aa  191  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  43.38 
 
 
231 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1301  deoxyribose-phosphate aldolase  49.77 
 
 
238 aa  189  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113978 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0036  deoxyribose-phosphate aldolase  45.58 
 
 
222 aa  186  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000477173  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  47.2 
 
 
241 aa  186  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  43.18 
 
 
235 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2538  deoxyribose-phosphate aldolase  42.72 
 
 
223 aa  186  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7285  deoxyribose-phosphate aldolase  45.58 
 
 
215 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  48.06 
 
 
317 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4274  deoxyribose-phosphate aldolase  46.05 
 
 
218 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2652  deoxyribose-phosphate aldolase  49.77 
 
 
223 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1239  deoxyribose-phosphate aldolase  43.06 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0134  deoxyribose-phosphate aldolase  48.11 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  45.07 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0730  deoxyribose-phosphate aldolase  45.07 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151995  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0129  deoxyribose-phosphate aldolase  45.79 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2737  deoxyribose-phosphate aldolase  49.77 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0124  deoxyribose-phosphate aldolase  45.79 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2211  deoxyribose-phosphate aldolase  46.26 
 
 
220 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2173  deoxyribose-phosphate aldolase  46.26 
 
 
220 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  45.93 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1556  deoxyribose-phosphate aldolase  49.31 
 
 
223 aa  181  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1543  deoxyribose-phosphate aldolase  50.68 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486801  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6286  deoxyribose-phosphate aldolase  50.68 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.576612 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6946  deoxyribose-phosphate aldolase  50.68 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1434  deoxyribose-phosphate aldolase  44.13 
 
 
229 aa  178  7e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  42.18 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0977  deoxyribose-phosphate aldolase  42.72 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.593139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3002  deoxyribose-phosphate aldolase  45.85 
 
 
231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00170896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1632  deoxyribose-phosphate aldolase  47.69 
 
 
226 aa  171  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101131  hitchhiker  0.000603292 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  42.25 
 
 
260 aa  171  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2070  deoxyribose-phosphate aldolase  42.92 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.661265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2833  deoxyribose-phosphate aldolase  42.25 
 
 
231 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0559245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2321  deoxyribose-phosphate aldolase  42.03 
 
 
221 aa  168  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000020157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0832  deoxyribose-phosphate aldolase  43.6 
 
 
236 aa  168  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08130  deoxyribose-phosphate aldolase  41.15 
 
 
269 aa  168  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3526  deoxyribose-phosphate aldolase  41.1 
 
 
256 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  40.76 
 
 
248 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2591  deoxyribose-phosphate aldolase  41.1 
 
 
225 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  43.48 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21200  deoxyribose-phosphate aldolase  45.21 
 
 
221 aa  161  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3950  deoxyribose-phosphate aldolase  42.79 
 
 
219 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2141  deoxyribose-phosphate aldolase  43.12 
 
 
215 aa  159  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00973111  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05590  deoxyribose-phosphate aldolase  41.89 
 
 
229 aa  157  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>