25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3543 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3543  UspA domain protein  100 
 
 		 293 aa  596  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3544  hypothetical protein  36.43 
 
 		 318 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  24.83 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0245  universal stress protein  24.48 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  23.59 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  27.24 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  21.53 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3232  UspA domain-containing protein  22.59 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499848  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  21.36 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0767  UspA domain protein  25.41 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5771  UspA domain protein  23.2 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  26.49 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  25.29 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  22.1 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  27.17 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5529  UspA domain protein  21.96 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  22.78 
 
 		 277 aa  49.3  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  26.67 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02880  hypothetical protein  19.88 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  29.79 
 
 		 294 aa  45.8  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.58 
 
 		 153 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  30.71 
 
 		 140 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  28.78 
 
 		 145 aa  43.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  25 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>