26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1141 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  100 
 
 		 366 aa  758    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  26.15 
 
 		 353 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  26.22 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  24.51 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  32.5 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  32.5 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  23.99 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 350 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  25.42 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  29.31 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  29.01 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  30.38 
 
 		 382 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  30.38 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  26.4 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  30.4 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  65.85 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  23.29 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  34.02 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  24.04 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  20.85 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0003  DNA replication and repair protein RecF  39.34 
 
 		 359 aa  46.2  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03481  recombination protein F  37.8 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4992  hypothetical protein  34.38 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  22.69 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  38.1 
 
 		 364 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  28.57 
 
 		 601 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>