261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31240 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31240  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 		 134 aa  274  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.652275  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2029  flagellar basal body rod protein  76.12 
 
 		 134 aa  221  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0980  protein of unknown function DUF1078 domain protein  63.16 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.442663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1648  protein of unknown function DUF1078 domain protein  63.91 
 
 		 131 aa  177  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2993  flagellar basal-body rod protein FlgC  62.12 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00271218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2349  protein of unknown function DUF1078 domain protein  60.9 
 
 		 132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0761  flagellar basal-body rod protein  48.15 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0839  hypothetical protein  48.46 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.29 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.22 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1357  flagellar basal body rod protein FlgC  38.69 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.81 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 		 138 aa  95.9  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.93 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1820  flagellar basal body rod protein FlgC  36.23 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.73 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1558  flagellar basal body rod protein FlgC  35.51 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.110702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1532  flagellar basal body rod protein FlgC  35.51 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.123411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1521  flagellar basal body rod protein FlgC  35.51 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1710  flagellar basal body rod protein FlgC  36.96 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1675  flagellar basal body rod protein FlgC  35.51 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1742  flagellar basal body rod protein FlgC  35.51 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3635  flagellar basal body rod protein FlgC  36.96 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0135  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.36 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1764  flagellar basal body rod protein FlgC  35.29 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1561  flagellar basal body rod protein FlgC  36.96 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.55 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.13 
 
 		 137 aa  92.8  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.31 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.31 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  34.9 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.57 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.79 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1213  flagellar basal body rod protein FlgC  35.76 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  35.25 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.96 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.96 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.1 
 
 		 145 aa  87  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  35.51 
 
 		 138 aa  87  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.56 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  37.23 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.93 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.41 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.37 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.56 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.57 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.31 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.06 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.56 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  33.56 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2285  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.03 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  35.57 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  35.07 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.86 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  34.81 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.77 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  35.07 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.04 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  34.81 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  33.56 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.56 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  34.81 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  36.03 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  34.69 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  36.03 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.07 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  36.03 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  36.03 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  36.03 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  33.56 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  34.56 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  33.56 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  33.56 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  31.39 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.51 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.97 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  28.68 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  33.58 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  34.72 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  34.19 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  31.16 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.34 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  31.16 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.81 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  34.29 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.81 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.64 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.83 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>