More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25570 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  100 
 
 		 495 aa  983    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  77.59 
 
 		 480 aa  646    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  63.82 
 
 		 491 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  69.53 
 
 		 506 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  68.49 
 
 		 491 aa  588  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  65.26 
 
 		 479 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  62.91 
 
 		 471 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  60.98 
 
 		 465 aa  519  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  59.45 
 
 		 468 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  59.74 
 
 		 468 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  58.82 
 
 		 493 aa  504  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  59.87 
 
 		 460 aa  498  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  57.56 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  58.81 
 
 		 471 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  58.39 
 
 		 478 aa  497  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  58.76 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  60 
 
 		 464 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  58.33 
 
 		 470 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  60.87 
 
 		 483 aa  488  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  59.87 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  57.93 
 
 		 467 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  59.09 
 
 		 460 aa  483  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  57.17 
 
 		 481 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  59.83 
 
 		 478 aa  473  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  58.21 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  58.55 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  55.98 
 
 		 467 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  58.67 
 
 		 463 aa  455  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  55.44 
 
 		 471 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  55.04 
 
 		 470 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  54.83 
 
 		 470 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  55.04 
 
 		 470 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  54.81 
 
 		 495 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  54.24 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  55.44 
 
 		 467 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  53.42 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.81 
 
 		 470 aa  259  6e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.77 
 
 		 474 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.12 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.89 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.25 
 
 		 562 aa  231  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.35 
 
 		 468 aa  230  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 		 459 aa  229  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 		 459 aa  229  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.89 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.89 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.59 
 
 		 459 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.39 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.81 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.82 
 
 		 464 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.72 
 
 		 459 aa  223  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.95 
 
 		 465 aa  223  7e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.3 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.82 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 		 458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 		 462 aa  220  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 		 468 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.55 
 
 		 463 aa  219  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.82 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.92 
 
 		 465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.28 
 
 		 464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.62 
 
 		 459 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.08 
 
 		 473 aa  217  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.93 
 
 		 468 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.37 
 
 		 470 aa  216  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 		 467 aa  216  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.52 
 
 		 585 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.39 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.98 
 
 		 465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.69 
 
 		 470 aa  213  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.45 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.59 
 
 		 465 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 		 457 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 		 471 aa  209  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.2 
 
 		 462 aa  209  9e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.96 
 
 		 465 aa  209  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.9 
 
 		 469 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.61 
 
 		 464 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.89 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.53 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3945  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  33.04 
 
 		 481 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332023  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.15 
 
 		 459 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.89 
 
 		 466 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.15 
 
 		 470 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.89 
 
 		 466 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.78 
 
 		 471 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.32 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.54 
 
 		 465 aa  205  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.35 
 
 		 459 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.26 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.21 
 
 		 480 aa  203  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.45 
 
 		 466 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.06 
 
 		 471 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  28.91 
 
 		 473 aa  202  9e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.6 
 
 		 465 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.6 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.54 
 
 		 469 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.95 
 
 		 465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>