57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1859 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  85.01 
 
 		 978 bp  680    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  88.18 
 
 		 978 bp  886    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1859    100 
 
 		 930 bp  1844    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  85.91 
 
 		 978 bp  745    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  88.44 
 
 		 978 bp  906    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  84.79 
 
 		 978 bp  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  85.55 
 
 		 978 bp  720    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  85.55 
 
 		 978 bp  720    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  86.45 
 
 		 978 bp  779    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  85.65 
 
 		 978 bp  729    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  84.62 
 
 		 978 bp  656    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  85.89 
 
 		 981 bp  708    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  85.3 
 
 		 978 bp  706    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  84.16 
 
 		 960 bp  628  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  84.07 
 
 		 978 bp  620  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  83.6 
 
 		 978 bp  589  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  83.43 
 
 		 978 bp  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  83.02 
 
 		 978 bp  549  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  83.42 
 
 		 951 bp  541  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  82.77 
 
 		 978 bp  531  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  82.45 
 
 		 991 bp  513  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  81.62 
 
 		 978 bp  430  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  86.45 
 
 		 597 bp  369  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  86.45 
 
 		 597 bp  369  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  88.71 
 
 		 561 bp  347  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1377    78.99 
 
 		 1010 bp  325  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  79.76 
 
 		 978 bp  321  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1538    83.81 
 
 		 1007 bp  307  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.987441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0945    85.79 
 
 		 479 bp  299  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.836757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1728  hypothetical protein  97.95 
 
 		 243 bp  266  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  81.65 
 
 		 978 bp  250  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  82.51 
 
 		 978 bp  242  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  84.33 
 
 		 624 bp  236  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1858    94.92 
 
 		 210 bp  178  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.681721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1889  hypothetical protein  87.9 
 
 		 267 bp  161  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0979  hypothetical protein  88.57 
 
 		 243 bp  151  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3809  hypothetical protein  81.99 
 
 		 339 bp  143  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3114    87.02 
 
 		 298 bp  125  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  78.4 
 
 		 882 bp  115  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3575    93.15 
 
 		 515 bp  105  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  86.36 
 
 		 978 bp  99.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1571  hypothetical protein  84.93 
 
 		 201 bp  99.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641007  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  86.36 
 
 		 978 bp  99.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  82.61 
 
 		 978 bp  97.6  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  82.32 
 
 		 978 bp  95.6  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  82.84 
 
 		 717 bp  83.8  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  81.82 
 
 		 597 bp  77.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  83.65 
 
 		 315 bp  71.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  80.82 
 
 		 981 bp  67.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  80.14 
 
 		 981 bp  60  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    86.15 
 
 		 1107 bp  58  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    86.15 
 
 		 902 bp  58  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0548    87.5 
 
 		 446 bp  56  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  90.7 
 
 		 972 bp  54  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  93.94 
 
 		 978 bp  50.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  85.25 
 
 		 978 bp  50.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  81.44 
 
 		 984 bp  50.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>