31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0464 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0464  MSHA biogenesis protein MshJ  100 
 
 		 216 aa  433  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3665  MSHA biogenesis protein MshJ  95.83 
 
 		 216 aa  421  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3488  MSHA biogenesis protein MshJ  94.91 
 
 		 216 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114  MSHA biogenesis protein MshJ  92.59 
 
 		 216 aa  363  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0482  MSHA biogenesis protein MshJ  79.63 
 
 		 216 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3837  MSHA biogenesis protein MshJ  79.63 
 
 		 216 aa  361  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0503  MSHA biogenesis protein MshJ  79.63 
 
 		 216 aa  361  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0506  MSHA biogenesis protein MshJ  78.7 
 
 		 216 aa  358  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0558  MSHA biogenesis protein MshJ  81.94 
 
 		 216 aa  348  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3753  MSHA biogenesis protein MshJ  60.65 
 
 		 218 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3770  MSHA biogenesis protein MshJ  60.19 
 
 		 218 aa  278  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4419  MSHA biogenesis protein MshJ  59.53 
 
 		 218 aa  277  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0542  MSHA biogenesis protein MshJ  58.6 
 
 		 216 aa  265  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0387  MSHA biogenesis protein MshJ  62.79 
 
 		 218 aa  261  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3349  MSHA biogenesis protein MshJ  59.26 
 
 		 218 aa  259  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0452  MSHA biogenesis protein MshJ  51.87 
 
 		 217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0168  MSHA biogenesis protein MshJ  32.74 
 
 		 230 aa  141  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2818  MSHA biogenesis protein MshJ  33.95 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002366  MSHA biogenesis protein MshJ  35.38 
 
 		 216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03700  hypothetical protein  34.56 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4578  hypothetical protein  28.7 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0891  hypothetical protein  27.35 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1133  hypothetical protein  28.03 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0346936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0383  MshA biogenesis protein, MshJ-like  32.89 
 
 		 225 aa  94.7  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0467  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHJ)  32.18 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0331  MSHA biogenesis protein MshJ  24.88 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00249  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshJ (pilus type IV)  29.77 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3276  MSHA biogenesis protein MshJ  32.42 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0751  hypothetical protein  27.27 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3094  MshA biogenesis protein, MshJ-like protein  29.22 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0762  hypothetical protein  21.1 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00540771  normal  0.362126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>