31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3488 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3488  MSHA biogenesis protein MshJ  100 
 
 		 216 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3665  MSHA biogenesis protein MshJ  99.07 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0464  MSHA biogenesis protein MshJ  94.91 
 
 		 216 aa  390  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114  MSHA biogenesis protein MshJ  91.67 
 
 		 216 aa  362  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0482  MSHA biogenesis protein MshJ  78.24 
 
 		 216 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3837  MSHA biogenesis protein MshJ  78.24 
 
 		 216 aa  357  5e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0503  MSHA biogenesis protein MshJ  78.24 
 
 		 216 aa  357  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0506  MSHA biogenesis protein MshJ  77.31 
 
 		 216 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0558  MSHA biogenesis protein MshJ  81.02 
 
 		 216 aa  345  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4419  MSHA biogenesis protein MshJ  60.47 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3753  MSHA biogenesis protein MshJ  59.72 
 
 		 218 aa  278  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3770  MSHA biogenesis protein MshJ  58.33 
 
 		 218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0542  MSHA biogenesis protein MshJ  58.6 
 
 		 216 aa  268  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0387  MSHA biogenesis protein MshJ  60.47 
 
 		 218 aa  259  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3349  MSHA biogenesis protein MshJ  58.33 
 
 		 218 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0452  MSHA biogenesis protein MshJ  51.4 
 
 		 217 aa  231  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0168  MSHA biogenesis protein MshJ  32.74 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2818  MSHA biogenesis protein MshJ  34.42 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002366  MSHA biogenesis protein MshJ  34.91 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03700  hypothetical protein  32.73 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4578  hypothetical protein  29.31 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0891  hypothetical protein  27.31 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0467  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHJ)  30.69 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0383  MshA biogenesis protein, MshJ-like  32.21 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1133  hypothetical protein  27.62 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0346936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00249  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshJ (pilus type IV)  29.77 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0331  MSHA biogenesis protein MshJ  23.5 
 
 		 219 aa  88.2  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3276  MSHA biogenesis protein MshJ  30.22 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0751  hypothetical protein  27.01 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3094  MshA biogenesis protein, MshJ-like protein  30.91 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0762  hypothetical protein  21.56 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00540771  normal  0.362126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>