29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4144 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  100 
 
 		 119 aa  243  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  55.17 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  49.14 
 
 		 117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  53.45 
 
 		 116 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00396  putative secreted protein containing plastocyanin domain  55.05 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  48.7 
 
 		 116 aa  130  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  47.32 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1382  protease  48.76 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  42.02 
 
 		 204 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  36.89 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  40.17 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  36.89 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  36.89 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  41.35 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  35.04 
 
 		 928 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  29.41 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  30.48 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  34.88 
 
 		 902 aa  64.7  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  34.83 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  34.83 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  31.76 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  34.83 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1875  cupredoxin-like domain  30.59 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2120  copper-translocating P-type ATPase  29.25 
 
 		 918 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.440139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0311  hypothetical protein  29.63 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0300  hypothetical protein  29.63 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0322  hypothetical protein  27.16 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.512657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  25.89 
 
 		 123 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>