21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3394 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3394  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  314  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3282  hypothetical protein  96.73 
 
 
153 aa  285  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0740  hypothetical protein  96.08 
 
 
153 aa  283  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0898  hypothetical protein  73.2 
 
 
153 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3477  hypothetical protein  73.2 
 
 
153 aa  237  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0862  hypothetical protein  72.55 
 
 
153 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0885  hypothetical protein  71.9 
 
 
153 aa  235  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0884  hypothetical protein  90.51 
 
 
137 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3118  hypothetical protein  73.86 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2997  hypothetical protein  50.35 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3285  hypothetical protein  46.1 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3179  hypothetical protein  43.17 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0592  hypothetical protein  44 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0677  hypothetical protein  40.97 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3862  hypothetical protein  43.24 
 
 
145 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3502  hypothetical protein  43.67 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0297  hypothetical protein  30.53 
 
 
160 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00071  hypothetical protein  33.62 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002283  hypothetical protein  32.76 
 
 
162 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.715737  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2187  hypothetical protein  30.61 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.45701  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3713  hypothetical protein  32.14 
 
 
158 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.767201  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>