More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3241 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
272 aa  550  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  90.44 
 
 
272 aa  501  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  76.34 
 
 
288 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  75.57 
 
 
290 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  76.36 
 
 
288 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  75.19 
 
 
288 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  77.43 
 
 
274 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  64.82 
 
 
268 aa  328  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  61.66 
 
 
254 aa  315  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  57.14 
 
 
254 aa  295  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  48 
 
 
260 aa  232  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  48.39 
 
 
259 aa  229  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  47.6 
 
 
260 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  47.04 
 
 
260 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  45.06 
 
 
255 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  43.87 
 
 
255 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  43.87 
 
 
255 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 
255 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  45.24 
 
 
255 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.86 
 
 
255 aa  188  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  41.02 
 
 
258 aa  186  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  45.45 
 
 
255 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  44.44 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  41.02 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  38.52 
 
 
266 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  37.94 
 
 
256 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  44.05 
 
 
255 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  41.11 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  37.65 
 
 
269 aa  178  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  40.62 
 
 
266 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  42.23 
 
 
293 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  40.62 
 
 
266 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  40.62 
 
 
266 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40.23 
 
 
268 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  40 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3462  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.49 
 
 
264 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0998  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.49 
 
 
264 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3333  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.49 
 
 
264 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  36.58 
 
 
259 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  41.11 
 
 
259 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  40.59 
 
 
269 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  38.15 
 
 
268 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  43.36 
 
 
265 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  37.45 
 
 
261 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  37.59 
 
 
266 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 
271 aa  168  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  33.73 
 
 
258 aa  168  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  39.2 
 
 
272 aa  168  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 
271 aa  168  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  37.07 
 
 
271 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  37.07 
 
 
271 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 
271 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  40.8 
 
 
258 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  37.07 
 
 
271 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 
271 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 
271 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 
271 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  36.58 
 
 
259 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.69 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  39.6 
 
 
265 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  41.25 
 
 
264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  36.19 
 
 
264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.8 
 
 
253 aa  165  9e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  41.18 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  38.59 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  36.19 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  34.63 
 
 
270 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  36.43 
 
 
271 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  44.49 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  36.02 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
270 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
270 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  35.51 
 
 
490 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
270 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  34.36 
 
 
270 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  38.33 
 
 
256 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
270 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
270 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1830  hemin importer ATP-binding subunit  39.48 
 
 
272 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1775  hemin importer ATP-binding subunit  39.48 
 
 
272 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0830  hemin importer ATP-binding subunit  39.48 
 
 
272 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1121  hemin importer ATP-binding subunit  39.48 
 
 
272 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.402824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0341  hemin importer ATP-binding subunit  39.48 
 
 
272 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853045  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2096  hemin importer ATP-binding subunit  39.48 
 
 
272 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.05 
 
 
258 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  36.61 
 
 
269 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  41.08 
 
 
260 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
270 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 
273 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 
264 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  35.41 
 
 
264 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.98 
 
 
270 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  41.22 
 
 
292 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  39.36 
 
 
260 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 
264 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0434  hemin importer ATP-binding subunit  39.48 
 
 
272 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  40.16 
 
 
259 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 
264 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>