30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3817 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  100 
 
 		 116 aa  239  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  67.24 
 
 		 116 aa  170  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  65.52 
 
 		 116 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  55.17 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  50.43 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1382  protease  54.1 
 
 		 122 aa  131  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  47.86 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00396  putative secreted protein containing plastocyanin domain  49.07 
 
 		 111 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  39.5 
 
 		 204 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  33.04 
 
 		 130 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  33.04 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  33.91 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  31.73 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  33.04 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  31.03 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  30.48 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  32.63 
 
 		 902 aa  57  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  30.38 
 
 		 928 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0322  hypothetical protein  30.86 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.512657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2120  copper-translocating P-type ATPase  33.73 
 
 		 918 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.440139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0300  hypothetical protein  30.86 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  25.29 
 
 		 311 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1875  cupredoxin-like domain  33.33 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550089 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  30.67 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  28.7 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  27.38 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  27.38 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  25 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  28.72 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>