More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2346 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2346  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0523662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1793  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  60.65 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1748  ABC transporter related  56.82 
 
 		 276 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00373907  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3310  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 236 aa  245  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1544  ABC transporter related  54.13 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2802  ABC transporter related  56.42 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1769  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  52.2 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0632527  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1898  ABC transporter related  51.87 
 
 		 236 aa  223  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2484  ABC transporter related  54.15 
 
 		 225 aa  221  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2744  ABC transporter related  48.78 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.600258  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1447  ABC transporter related  43.33 
 
 		 216 aa  185  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3493  ABC transporter related  45.37 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1497  ABC transporter related  44.93 
 
 		 222 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.68 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  37.6 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02560  ABC transporter  36.56 
 
 		 249 aa  124  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  35.8 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  33.33 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.02 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0259  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.13 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3919  ABC transporter related protein  34.45 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.62 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  34.68 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0104  ATPase  29.44 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07291  putative phosphonate ABC transporter  29.03 
 
 		 244 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  32.92 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.66 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  34.8 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  32.13 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07271  putative phosphonate ABC transporter  32.76 
 
 		 246 aa  111  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0413071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.71 
 
 		 280 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.02 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.13 
 
 		 307 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.13 
 
 		 307 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.13 
 
 		 307 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  31.6 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  33.05 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.77 
 
 		 307 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  31.33 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.75 
 
 		 266 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  32.75 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  32.13 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  34.47 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.32 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.98 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0672  ATPase  30.04 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07251  putative phosphonate ABC transporter  30.47 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.38 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.2 
 
 		 261 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.62 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  32.79 
 
 		 266 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  32.07 
 
 		 253 aa  105  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.13 
 
 		 284 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.36 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1293  ATPase  35.94 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4623  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.09 
 
 		 269 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.61 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11301  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  31.35 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0500512 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07451  putative phosphonate ABC transporter  29.92 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.56 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.56 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0437  ABC transporter related protein  33.47 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0458  ABC type ATPase  30.56 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.345895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0422  ABC type ATPase  30.56 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.861299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14301  putative phosphonate ABC transporter  31.85 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  32.91 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  30.24 
 
 		 246 aa  101  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0874  ABC transporter-like protein  30.52 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  30.56 
 
 		 499 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.49 
 
 		 367 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  33.92 
 
 		 277 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2407  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  37.5 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  31.58 
 
 		 272 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0365  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.3 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  31.42 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2080  ABC transporter related  29.91 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.58 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  33.62 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  34.56 
 
 		 363 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0640  ABC transporter related  35.39 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  29.37 
 
 		 309 aa  99  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07851  putative phosphonate ABC transporter  30.49 
 
 		 245 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3337  ABC transporter related  30.65 
 
 		 274 aa  99  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1114  ABC transporter related  37.13 
 
 		 343 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0746662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.2 
 
 		 270 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1113  ABC transporter related  37.13 
 
 		 343 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  32.76 
 
 		 234 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1184  ATPase  35.81 
 
 		 225 aa  98.2  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.795417  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  32.02 
 
 		 333 aa  98.2  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 		 269 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.19 
 
 		 273 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  30.31 
 
 		 257 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  33.18 
 
 		 367 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  30.3 
 
 		 370 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>