85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2355 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2355  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0293083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2471  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  98.73 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  0.0767721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2368  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  97.89 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1991  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  96.2 
 
 		 237 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00373445  hitchhiker  0.0000000547334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2124  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  76.37 
 
 		 238 aa  353  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1911  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  70.13 
 
 		 262 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.494098  hitchhiker  0.0000706495 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2122  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  72.81 
 
 		 270 aa  325  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.737189  hitchhiker  0.000240208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1856  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  71.43 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.636269  hitchhiker  0.0000000136741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2472  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase-related protein  72.69 
 
 		 252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2187  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.6 
 
 		 230 aa  245  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.222762  normal  0.0101242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2419  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  52.42 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  decreased coverage  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1764  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  50.43 
 
 		 236 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.357856  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1813  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  54.55 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.877549  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1861  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.03 
 
 		 250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1646  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase-related protein  56.61 
 
 		 212 aa  218  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.806668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1990  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  52.94 
 
 		 192 aa  198  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3180  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  44.79 
 
 		 240 aa  164  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2444  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  41.75 
 
 		 223 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.54345  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2193  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  42.64 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1429  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.46 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02545  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  42.86 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.457217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3368  putative D,D-carboxypeptidase-related protein  40.51 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0527224 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2376  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  35.94 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3163  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.22 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000280398  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1168  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.59 
 
 		 224 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1254  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  43.39 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3502  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.63 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3140  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  43.39 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1371  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.39 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002796  D,D-carboxypeptidase-related protein  37.83 
 
 		 232 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2977  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.75 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0579  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase-related protein  38.07 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1079  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.24 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.234165  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03184  hypothetical protein  35.37 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1735  VanY family protein  36.61 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09648  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.93 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.538817  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1065  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  23.3 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.3 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3005  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.62 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1919  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.57 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345839  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3298  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.62 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1934  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.62 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.3783  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  25.64 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0595  putative carboxypeptidase  28.97 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1371  carboxypeptidase-like protein  28.06 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.919342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.27 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000420976  normal  0.257311 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08211  putative carboxypeptidase  27.14 
 
 		 182 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2059  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.27 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1631  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.34 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.303902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1862  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.24 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.018097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3126  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.95 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2101  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.62 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1885  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.62 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.699634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1923  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.62 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2141  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.97 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2169  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.97 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.742674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2070  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.62 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05720  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.17 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.435379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  24.68 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.47 
 
 		 273 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.32 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1686  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.64 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000186356  hitchhiker  5.41079e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1875  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.97 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.32 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.32 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.32 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.32 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2526  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.11 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080639  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  28.57 
 
 		 237 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2349  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.11 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.32 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2541  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  24.84 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35548e-47 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4445  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  36 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1557  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.15 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  24.03 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2308  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.48 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000166242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2266  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.11 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0349976  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0769  putative carboxypeptidase  26.43 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  28.8 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  24.68 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04455  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family  27.15 
 
 		 265 aa  42.4  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  27.52 
 
 		 269 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0495  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  23.57 
 
 		 332 aa  42  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1899  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  23.74 
 
 		 289 aa  42  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>