30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0358 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  94.75 
 
 
305 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  87.62 
 
 
323 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  92.28 
 
 
272 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  50.93 
 
 
277 aa  315  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  57.14 
 
 
260 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  55.04 
 
 
272 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  57.03 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  56.25 
 
 
287 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  57.31 
 
 
221 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  55.73 
 
 
236 aa  278  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  54.15 
 
 
255 aa  275  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  50 
 
 
251 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  51.78 
 
 
213 aa  260  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  51.79 
 
 
223 aa  259  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  52.53 
 
 
229 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  42.59 
 
 
231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  34.43 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  31.97 
 
 
216 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  27.04 
 
 
524 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  25.42 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  22.78 
 
 
476 aa  52.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  24.47 
 
 
240 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  25.14 
 
 
227 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  23.28 
 
 
199 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2286  hypothetical protein  26.8 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  24.48 
 
 
442 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  21.39 
 
 
215 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1029  hypothetical protein  23.56 
 
 
225 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617928  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  27.36 
 
 
208 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0274676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>