More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27870 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27870  primary replicative DNA helicase  100 
 
 		 464 aa  949    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0308941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0026  replicative DNA helicase  68.71 
 
 		 470 aa  647    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11520  primary replicative DNA helicase  66.74 
 
 		 473 aa  614  9.999999999999999e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.213802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0024  replicative DNA helicase  46.36 
 
 		 479 aa  420  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  45.93 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  44.65 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  45.87 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  44.65 
 
 		 439 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  45.23 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  44.34 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  45.02 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  44.49 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  44.19 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  45.74 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  43.28 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  43.54 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  45.41 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  43.42 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  45.03 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  43.96 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  45.29 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  42.82 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  42.66 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  42.35 
 
 		 481 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  45.45 
 
 		 440 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  43.28 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  42.66 
 
 		 449 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  43.58 
 
 		 442 aa  362  6e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  44.67 
 
 		 460 aa  362  8e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  44.34 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  42.86 
 
 		 456 aa  359  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  42.82 
 
 		 454 aa  359  7e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  44.37 
 
 		 473 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  42.32 
 
 		 456 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  41.84 
 
 		 449 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  41.34 
 
 		 445 aa  356  5.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  42.99 
 
 		 451 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  44.29 
 
 		 469 aa  355  6.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  44.03 
 
 		 469 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  42.76 
 
 		 509 aa  353  4e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  42.38 
 
 		 460 aa  352  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  40.84 
 
 		 513 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  44.06 
 
 		 472 aa  352  8e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  44.32 
 
 		 447 aa  352  8e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  42.57 
 
 		 468 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  43.47 
 
 		 476 aa  352  8.999999999999999e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  42.76 
 
 		 450 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  41.16 
 
 		 478 aa  351  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  43.47 
 
 		 476 aa  352  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  44.98 
 
 		 468 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  44.39 
 
 		 473 aa  350  3e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  44.37 
 
 		 446 aa  350  3e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  44.19 
 
 		 452 aa  350  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  44.14 
 
 		 459 aa  350  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  42.21 
 
 		 468 aa  349  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  41.99 
 
 		 468 aa  349  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  43.25 
 
 		 472 aa  348  9e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  44.39 
 
 		 472 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  41.99 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  41.99 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  44.39 
 
 		 472 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  42.31 
 
 		 461 aa  348  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  41.29 
 
 		 466 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  44.07 
 
 		 477 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  42.66 
 
 		 468 aa  347  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  41.29 
 
 		 466 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  42.11 
 
 		 443 aa  346  4e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  44.12 
 
 		 460 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  44.12 
 
 		 460 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  42.76 
 
 		 508 aa  346  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  44.12 
 
 		 460 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  44.12 
 
 		 460 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  44.12 
 
 		 460 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  44.12 
 
 		 460 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  40.99 
 
 		 446 aa  346  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  44.12 
 
 		 460 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  43.86 
 
 		 460 aa  346  6e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  43.89 
 
 		 460 aa  346  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  44.98 
 
 		 441 aa  346  6e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  41.45 
 
 		 471 aa  345  8e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  42.79 
 
 		 465 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  43.44 
 
 		 468 aa  345  8.999999999999999e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  45.1 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  40.22 
 
 		 451 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  43.44 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  43.44 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  41.2 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  41.63 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  41.07 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  43.79 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  43.28 
 
 		 452 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  40.96 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>