27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11160 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  314  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  38 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  37.58 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  33.56 
 
 
151 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  36.67 
 
 
154 aa  104  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  31.76 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  30.83 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24240  hypothetical protein  28.08 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  33.83 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  32.84 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  28.67 
 
 
141 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  29.93 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  29.77 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  27.21 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  26.95 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  38.95 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  29.41 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  27.74 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  27.94 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  31.16 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0266  hypothetical protein  27.94 
 
 
163 aa  51.6  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.041266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3018  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.14 
 
 
518 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  26.17 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  29.69 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  24.6 
 
 
306 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2771  hypothetical protein  26.62 
 
 
165 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>