28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03680 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_03680  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 216 aa  446  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12460  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  107  9.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08190  transcriptional regulator, tetR family  33.85 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.137766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17710  hypothetical protein  27.05 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.746787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27610  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.424005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0104  transcriptional regulator  27.34 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000798599  hitchhiker  0.000000102912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 326 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 242 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 236 aa  42  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 188 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0733  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 162 aa  41.6  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0939  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 159 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0948  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 159 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.961302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0914  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 159 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3421  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 159 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 228 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 186 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>