283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1661 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0695  peptidase M16C associated domain-containing protein  54.51 
 
 
968 aa  1074    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00570537  decreased coverage  0.000127809 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0345  Peptidase M16C associated domain protein  50.1 
 
 
970 aa  920    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0396626  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1565  Peptidase M16C associated domain protein  53.25 
 
 
968 aa  985    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0498145  normal  0.0547201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2677  PreP peptidase  55.68 
 
 
1046 aa  1075    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1365  Peptidase M16C associated domain protein  53.97 
 
 
968 aa  990    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_232  predicted protein  41.78 
 
 
986 aa  769    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1780  Peptidase M16C associated domain protein  52.15 
 
 
969 aa  949    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126781  normal  0.432438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0158  peptidase M16C associated domain-containing protein  55.27 
 
 
968 aa  1090    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41654  predicted protein  46.24 
 
 
979 aa  912    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00193617  normal  0.306826 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1656  putative peptidase  36.35 
 
 
973 aa  671    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0884161  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1395  peptidase, putative  36.83 
 
 
973 aa  677    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0490  Peptidase M16C associated domain protein  52.42 
 
 
969 aa  1007    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0645  peptidase M16C associated domain-containing protein  36.6 
 
 
992 aa  654    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1661  peptidase M16C associated domain-containing protein  100 
 
 
976 aa  1999    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2044  peptidase M16C associated domain-containing protein  55.03 
 
 
964 aa  1038    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0673  metalloprotease  34.46 
 
 
985 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223334  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2871  peptidase M16C associated domain-containing protein  34 
 
 
987 aa  511  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000230302  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1865  M16 family peptidase  32.04 
 
 
1017 aa  492  1e-137  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000469623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04570  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  32.87 
 
 
985 aa  489  1e-136  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1179  peptidase M16C associated  30.79 
 
 
987 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1643  peptidase M16C associated  35.3 
 
 
972 aa  481  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  normal  0.901695 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1217  Peptidase M16C associated domain protein  35.18 
 
 
999 aa  476  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00171078  normal  0.0476077 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1478  Peptidase M16C associated domain protein  34.38 
 
 
970 aa  476  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0378  Peptidase M16C associated domain protein  32.48 
 
 
1010 aa  464  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.858415  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1130  peptidase M16-like  31.83 
 
 
970 aa  462  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.827511  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20700  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  32.72 
 
 
972 aa  455  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1857  putative metalloprotease  31.89 
 
 
983 aa  452  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4245  peptidase M16C associated domain-containing protein  31.64 
 
 
973 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157444  hitchhiker  0.0000000002425 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32286  predicted protein  32.99 
 
 
1034 aa  445  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.414837  normal  0.522406 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2076  peptidase M16-like  32.02 
 
 
983 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2936  peptidase M16C associated domain-containing protein  33.37 
 
 
967 aa  432  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0337172  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1885  peptidase M16C associated domain-containing protein  31.28 
 
 
974 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0211  insulinase family metalloprotease  31.87 
 
 
975 aa  425  1e-117  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0233  peptidase M16 inactive domain protein  28.44 
 
 
971 aa  422  1e-116  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.312549  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0197  Peptidase M16C associated domain protein  30.4 
 
 
949 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03853  Mitochondrial presequence protease Precursor (EC 3.4.24.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6H7]  29.49 
 
 
1049 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901124  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1842  peptidase M16 familiy  27.8 
 
 
1024 aa  369  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.284572  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1843  peptidase M16C associated domain-containing protein  29.09 
 
 
1032 aa  362  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000453364  unclonable  0.00000000218752 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2129  peptidase M16-like  27.36 
 
 
1025 aa  360  9e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2447  peptidase M16 domain protein  25.56 
 
 
1137 aa  334  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76282  predicted protein  27.68 
 
 
1046 aa  322  1.9999999999999998e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.967871  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_006686  CND04540  cytoplasm protein, putative  23.15 
 
 
1054 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0121322  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84931  predicted protein  27.69 
 
 
1049 aa  109  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09434  zinc metalloprotease, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07610)  21.84 
 
 
1057 aa  98.6  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  27.66 
 
 
937 aa  89.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  26.55 
 
 
945 aa  81.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  29.95 
 
 
896 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  28.06 
 
 
868 aa  75.1  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  23.22 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  24.44 
 
 
419 aa  66.6  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  30.94 
 
 
878 aa  66.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  25.37 
 
 
921 aa  65.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  24.44 
 
 
419 aa  65.1  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  30.11 
 
 
435 aa  65.1  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1582  peptidase M16 domain protein  25.41 
 
 
434 aa  63.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157753  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  24.44 
 
 
419 aa  62.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  27.45 
 
 
937 aa  62.4  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  23.81 
 
 
436 aa  61.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1147  peptidase M16 domain-containing protein  25.14 
 
 
431 aa  61.2  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  24.16 
 
 
422 aa  60.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  23.65 
 
 
422 aa  61.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  26.78 
 
 
919 aa  60.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  25.5 
 
 
421 aa  59.7  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  27.94 
 
 
934 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  26.74 
 
 
928 aa  59.7  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  26.76 
 
 
462 aa  59.7  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  25.65 
 
 
949 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  26.67 
 
 
424 aa  58.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  24.87 
 
 
421 aa  58.2  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  22.64 
 
 
421 aa  58.2  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6664  peptidase M16 domain protein  24.08 
 
 
452 aa  57.8  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  24.74 
 
 
420 aa  57.4  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  24.15 
 
 
912 aa  57.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  21.1 
 
 
419 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  24.41 
 
 
458 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  26.57 
 
 
428 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  24.3 
 
 
434 aa  56.6  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  22.38 
 
 
422 aa  57  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  23.72 
 
 
912 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  26.09 
 
 
418 aa  56.2  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3525  peptidase M16 domain-containing protein  25.6 
 
 
421 aa  55.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.855558  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  26.44 
 
 
457 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2248  peptidase M16 domain-containing protein  27.6 
 
 
647 aa  56.2  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.082562  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  25.82 
 
 
466 aa  56.2  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  22.16 
 
 
948 aa  56.2  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  21.7 
 
 
413 aa  56.2  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  25.91 
 
 
441 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  27.23 
 
 
962 aa  55.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  22.77 
 
 
942 aa  55.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  25 
 
 
467 aa  55.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  27.23 
 
 
962 aa  55.5  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  27.23 
 
 
962 aa  55.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  27.27 
 
 
962 aa  55.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  27.23 
 
 
962 aa  55.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  27.23 
 
 
962 aa  55.5  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  27.23 
 
 
962 aa  55.1  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  27.23 
 
 
962 aa  55.5  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  27.23 
 
 
962 aa  55.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  27.23 
 
 
962 aa  55.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  25.54 
 
 
418 aa  55.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>