More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1207 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1207  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
436 aa  858    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1236  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.35 
 
 
438 aa  213  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0808  xanthine/uracil/vitamin C permease  31.15 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.10386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0770  Xanthine/uracil/vitamin C permease  30.07 
 
 
441 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  26.64 
 
 
451 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  27.69 
 
 
461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  27.84 
 
 
452 aa  130  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  27.61 
 
 
452 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  28.67 
 
 
438 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  26.15 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  27.83 
 
 
466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  26.98 
 
 
449 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  26.98 
 
 
455 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  27.27 
 
 
451 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  26.76 
 
 
455 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  25.39 
 
 
470 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4531  xanthine/uracil/vitamin C permease  27.67 
 
 
443 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.720055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  26.26 
 
 
465 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  27.27 
 
 
451 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1511  uracil-xanthine permease  25.18 
 
 
413 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0982636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  27.52 
 
 
451 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  27.16 
 
 
438 aa  104  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  24.09 
 
 
825 aa  103  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  26.17 
 
 
445 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1425  xanthine permease  24.34 
 
 
449 aa  103  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  24.27 
 
 
458 aa  102  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  24.55 
 
 
452 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0895  uracil-xanthine permease  24.25 
 
 
413 aa  103  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  27.76 
 
 
451 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1705  uracil-xanthine permease  23.87 
 
 
413 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.297144  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  26.63 
 
 
431 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0206  uracil-xanthine permease  24.14 
 
 
413 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1399  Xanthine/uracil/vitamin C permease  26.01 
 
 
450 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106582 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  26.4 
 
 
459 aa  100  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  26.89 
 
 
458 aa  99.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  26.07 
 
 
459 aa  98.2  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000668836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  25.79 
 
 
446 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4627  xanthine/uracil permease family protein  24.25 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.124277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4913  xanthine/uracil/vitamin C permease  22.75 
 
 
426 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  24.6 
 
 
444 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2514  xanthine/uracil/vitamin C permease  24.34 
 
 
457 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317709  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4239  xanthine/uracil permease family protein  24.53 
 
 
431 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4601  xanthine/uracil permease family protein  24.38 
 
 
435 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  24.33 
 
 
463 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0012  xanthine/uracil permease family protein  22.28 
 
 
426 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0625  xanthine permease  24.94 
 
 
428 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0234  uracil-xanthine permease  26.19 
 
 
487 aa  94.4  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.72868  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0629  Xanthine/uracil permease  27.36 
 
 
454 aa  94.4  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0040794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  23.49 
 
 
633 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  25.06 
 
 
647 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  24.4 
 
 
435 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4386  xanthine/uracil permease family protein  24.77 
 
 
431 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.694966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4227  xanthine/uracil permease family protein  24.02 
 
 
431 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  27.07 
 
 
452 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  23.36 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4725  xanthine/uracil permease family protein  24.77 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.536071  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  24.69 
 
 
442 aa  92  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  22.45 
 
 
440 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4630  xanthine/uracil permease family protein  24.25 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  22.45 
 
 
440 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  22.45 
 
 
440 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4330  xanthine/uracil/vitamin C permease  24.54 
 
 
431 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  22.22 
 
 
440 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  22.22 
 
 
440 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  22.22 
 
 
440 aa  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  22.22 
 
 
440 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  22.22 
 
 
440 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  22.58 
 
 
440 aa  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  22.22 
 
 
440 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  26.61 
 
 
457 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  22.22 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  25.49 
 
 
465 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  25.86 
 
 
479 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1798  Xanthine/uracil/vitamin C permease  25.11 
 
 
580 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426029 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4604  xanthine/uracil permease family protein  24.18 
 
 
434 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  23.13 
 
 
457 aa  87  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3292  uracil-xanthine permease  25.34 
 
 
463 aa  87  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967032  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0106  Xanthine/uracil/vitamin C permease  24.27 
 
 
450 aa  86.7  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  22.99 
 
 
457 aa  86.7  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0418  Xanthine/uracil/vitamin C permease  25.61 
 
 
464 aa  86.7  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  22.1 
 
 
489 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3080  xanthine/uracil permease  23.98 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  22.3 
 
 
525 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  25.78 
 
 
466 aa  83.2  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  26.82 
 
 
466 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  24.35 
 
 
462 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  24.39 
 
 
494 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0701  xanthine/uracil permease family protein  25.57 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  23.18 
 
 
665 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  22.25 
 
 
482 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4610  xanthine permease  23.54 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  22.25 
 
 
482 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0943  uracil-xanthine permease  23.39 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  22.63 
 
 
453 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  22.3 
 
 
525 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  23.32 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  23.32 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0536  xanthine/uracil permease  24.32 
 
 
448 aa  82  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490682  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1828  uracil-xanthine permease  25.84 
 
 
442 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  22.25 
 
 
482 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>