More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0962 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
302 aa  628  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  45.55 
 
 
305 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  44.22 
 
 
305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  36.82 
 
 
328 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
309 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
306 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  36.48 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
309 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 
308 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
317 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  36.55 
 
 
323 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3221  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
326 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.452086  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 
337 aa  123  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2973  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
326 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473581  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  33.61 
 
 
642 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
326 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1005  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
323 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  30.77 
 
 
326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5926  succinoglycan biosynthesis protein  27.36 
 
 
310 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
296 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0658  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
316 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4592  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
310 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0936  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.41 
 
 
323 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0930  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.41 
 
 
323 aa  93.6  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0107  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.69 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0097  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.69 
 
 
351 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4238  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
330 aa  89.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
307 aa  89  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0289  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  23.3 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  27.64 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  43.3 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  44.33 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  43.3 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  30.32 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  25.82 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  21.48 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  43.3 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  43.3 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1352  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  28.51 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  43.3 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  22.64 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  21.7 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  26.61 
 
 
1065 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  21.7 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.84 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.84 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.84 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.84 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.84 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.84 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
528 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.82 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  26.61 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  27.98 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  26.13 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.13 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.13 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  26.13 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  26.13 
 
 
316 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.13 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
335 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.58 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>