More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2662 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2662  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 120 aa  248  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.553385  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1512  rhodanese domain-containing protein  45.28 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.766741  normal  0.549953 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  41.38 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  42.37 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  42.37 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  31.13 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.85 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  39 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  35.79 
 
 		 484 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  30.56 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  35.79 
 
 		 484 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.05 
 
 		 478 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.05 
 
 		 478 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  35.05 
 
 		 478 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 390 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  31.18 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  34.41 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  30 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 177 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  25.69 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  28.3 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  25.69 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.02 
 
 		 478 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  30.11 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  25.93 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  30.11 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1694  Rhodanese domain protein  35.42 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  30.19 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  25.69 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  31.78 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.88 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0892  Rhodanese domain protein  33.73 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  29.25 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  30.93 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 		 469 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  25.69 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  31.86 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  33.72 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  27.96 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  31.91 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  34.52 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  34.18 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  30.11 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  29.36 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  28.3 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0941  rhodanese-domain protein  31.37 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000120327  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  26.92 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  31.76 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  31.37 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  33.68 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32.26 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  32.58 
 
 		 280 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  30.11 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  29.52 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.58 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  27.96 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  29.55 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  31.76 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  26.67 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  28.16 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  32.35 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  31.76 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  27.96 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  30.39 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  31.82 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.63 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  29.9 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  32.22 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0174  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  31.65 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  38.1 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 		 470 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  29.52 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 		 478 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  27.96 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  30.59 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  30.59 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  30.59 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>