More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1853 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1374  hypothetical protein  85.27 
 
 		 465 aa  839    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.817438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1519  iron-sulfur cluster-binding protein  86.21 
 
 		 464 aa  820    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3010  protein of unknown function DUF162  85.27 
 
 		 464 aa  817    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1337  hypothetical protein  85.43 
 
 		 464 aa  816    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3005  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  82.47 
 
 		 462 aa  823    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  84.4 
 
 		 464 aa  814    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  86.21 
 
 		 464 aa  847    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  86 
 
 		 464 aa  825    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 462 aa  968    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2907  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  86.65 
 
 		 464 aa  828    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2442  iron-sulfur cluster-binding protein  78.22 
 
 		 466 aa  758    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2997  hypothetical protein  84.18 
 
 		 457 aa  832    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3923  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  82.26 
 
 		 457 aa  786    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1351  hypothetical protein  85.05 
 
 		 464 aa  816    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  56.56 
 
 		 458 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3066  protein of unknown function DUF162  56.11 
 
 		 458 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  51.88 
 
 		 458 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  53.81 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2976  hypothetical protein  55.56 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  51.1 
 
 		 458 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  50.66 
 
 		 457 aa  482  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1436  hypothetical protein  54.94 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4211  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.44 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  49.34 
 
 		 459 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_002950  PG1172  iron-sulfur cluster binding protein, putative  52.87 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0696  protein of unknown function DUF162  50.98 
 
 		 466 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527236  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5818  hypothetical protein  48.09 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  normal  0.128266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2646  protein of unknown function DUF162  48.04 
 
 		 524 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2839  protein of unknown function DUF162  48.04 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2616  hypothetical protein  48.04 
 
 		 524 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5428  protein of unknown function DUF162  48.12 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1177  putative electron transport protein  47.23 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0190009  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2929  hypothetical protein  48.04 
 
 		 523 aa  428  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1270  protein of unknown function DUF162  46.02 
 
 		 477 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  38.41 
 
 		 475 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  39.5 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  40.67 
 
 		 476 aa  315  9e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  37.83 
 
 		 528 aa  313  4.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  37 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 		 501 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  38.03 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  35.97 
 
 		 473 aa  310  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  37.78 
 
 		 475 aa  309  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  39.64 
 
 		 477 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  39.64 
 
 		 482 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  39.03 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3037  protein of unknown function DUF162  37.44 
 
 		 467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.779274  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  36.88 
 
 		 493 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  39.41 
 
 		 477 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  36.88 
 
 		 493 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  37.24 
 
 		 475 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  38.08 
 
 		 486 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  37.47 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  37.24 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  37.24 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  37.24 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  37.24 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  36.12 
 
 		 494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  39.77 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  39.77 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  37.24 
 
 		 475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  40.11 
 
 		 480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  41.87 
 
 		 463 aa  305  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  39.19 
 
 		 482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  42.47 
 
 		 480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  37.24 
 
 		 475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  37.24 
 
 		 475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  38.67 
 
 		 496 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  38.2 
 
 		 478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  36.01 
 
 		 473 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  36.87 
 
 		 475 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  39.24 
 
 		 475 aa  302  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  42.41 
 
 		 475 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  36.78 
 
 		 475 aa  302  9e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4767  iron-sulfur cluster binding protein  37.73 
 
 		 484 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  39.23 
 
 		 482 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4386  Iron-sulfur cluster binding protein  37.73 
 
 		 484 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4473  iron-sulfur cluster binding protein  37.73 
 
 		 484 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.905918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  38.25 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  36.5 
 
 		 472 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  37.24 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  38.96 
 
 		 490 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  36.1 
 
 		 470 aa  299  9e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0890  iron-sulfur cluster binding protein  37.89 
 
 		 510 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  38.58 
 
 		 498 aa  298  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0885  iron-sulfur cluster binding protein  37.68 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  37.53 
 
 		 473 aa  296  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04080  (4Fe-4S) cluster-containing protein  36.55 
 
 		 493 aa  296  6e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  42.49 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05120  (4Fe-4S) cluster-containing protein  37.92 
 
 		 545 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1754  iron-sulfur cluster binding protein  36.49 
 
 		 512 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258831  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  41.93 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2721  Iron-sulfur cluster binding protein  39.16 
 
 		 471 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  39.39 
 
 		 456 aa  294  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  38.27 
 
 		 485 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  38.25 
 
 		 471 aa  293  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  36.32 
 
 		 479 aa  292  7e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  37.44 
 
 		 470 aa  292  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  38.29 
 
 		 481 aa  292  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  39.84 
 
 		 486 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>