99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0718 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0718  patatin  100 
 
 		 344 aa  714    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  75.48 
 
 		 335 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  75.16 
 
 		 335 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  70.33 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  74.53 
 
 		 380 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  71.26 
 
 		 372 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  70.66 
 
 		 372 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  74.29 
 
 		 383 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  74.52 
 
 		 372 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  64.33 
 
 		 378 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  50.15 
 
 		 343 aa  319  5e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  53.22 
 
 		 345 aa  311  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  43.27 
 
 		 422 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  43.27 
 
 		 424 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  42.95 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  40.74 
 
 		 638 aa  219  7.999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  39.53 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  36.83 
 
 		 357 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  36.51 
 
 		 364 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  36.51 
 
 		 364 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  36.51 
 
 		 364 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  36.51 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  36.48 
 
 		 357 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  34.81 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  36.48 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  36.48 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  36.48 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  36.48 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  37.62 
 
 		 356 aa  195  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  36.16 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  36.16 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  36.16 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  34.59 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  33.56 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  32.21 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  39.61 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  30.98 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  32.43 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  37.86 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  37.38 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  28.03 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  26.4 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  26.73 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  26.64 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  26.4 
 
 		 284 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  26.4 
 
 		 284 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  26.4 
 
 		 284 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  26.64 
 
 		 284 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  26.4 
 
 		 284 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  30.16 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  26.07 
 
 		 284 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  26.64 
 
 		 284 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  31.19 
 
 		 290 aa  97.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  31.13 
 
 		 289 aa  96.7  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  26.77 
 
 		 283 aa  96.3  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  28.76 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  29.67 
 
 		 293 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  27.38 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  30.87 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  29.33 
 
 		 293 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  28.16 
 
 		 279 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  29.08 
 
 		 293 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  30.55 
 
 		 290 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  28.52 
 
 		 279 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  28.74 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  28.3 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  27.82 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  26.79 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  26.69 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  26.79 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  26.79 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  24.67 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  25.79 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  27.07 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  29.47 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  30.24 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  24.4 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  26.3 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  26.51 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  25.19 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  28.64 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  39.08 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  24.55 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2927  patatin  24.89 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.224599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  25 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  27.65 
 
 		 314 aa  50.4  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  25 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  20.33 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  24.77 
 
 		 240 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  34.95 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  25.54 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.05 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  23.78 
 
 		 382 aa  46.2  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45660  predicted protein  25.43 
 
 		 593 aa  46.2  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.912846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  48.89 
 
 		 352 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  24.88 
 
 		 293 aa  43.5  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14077  predicted protein  45.31 
 
 		 594 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  23.85 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  25.41 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>