More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0015 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  100 
 
 		 345 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  88.99 
 
 		 345 aa  638    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  88.99 
 
 		 345 aa  637    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  88.99 
 
 		 345 aa  638    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  65.89 
 
 		 343 aa  467  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  65.01 
 
 		 343 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  64.72 
 
 		 343 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  61.22 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  60.93 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  60.93 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0769  IS630 family transposase  59.24 
 
 		 195 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2896  transposase  74.03 
 
 		 77 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2577  IS630 orf  61.63 
 
 		 86 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.093225  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  27.38 
 
 		 355 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  27.38 
 
 		 355 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  27.38 
 
 		 355 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0065  IS630, transposase, truncation  67.61 
 
 		 72 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3282  IS630 family transposase  38.41 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0042  IS630, transposase, truncation  63.38 
 
 		 72 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.92 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.69 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.12 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.01 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.01 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.01 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.36 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.36 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.36 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.36 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.36 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.36 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.36 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.36 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.36 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7411  hypothetical protein  28.53 
 
 		 344 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.69 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.69 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.69 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.36 
 
 		 350 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.04 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  26.1 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  25.79 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  25.79 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  28.12 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  23.33 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  25.79 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  23.33 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  23.33 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  23.75 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  28.12 
 
 		 626 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2928  hypothetical protein  24.23 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  25.47 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  27.65 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  23.15 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  23.15 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  28.75 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  25.55 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  28.75 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  24.48 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  24.48 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  24.48 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  23.15 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  23.15 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  23.15 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  23.15 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  23.15 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  23.15 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  23.15 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  23.15 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  27.3 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  23.15 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0231  hypothetical protein  26.14 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  28.43 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  28.43 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  28.43 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  23.46 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  27.43 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  22.85 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  23.82 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  31.13 
 
 		 168 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  28.23 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  25.58 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  25 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  27.43 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  24.5 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1515  hypothetical protein  29.56 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  23.51 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06388  hypothetical protein  25.08 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02463  hypothetical protein  25.08 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02022  hypothetical protein  25.08 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  23.81 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01089  hypothetical protein  25.08 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  25.34 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06044  hypothetical protein  25.08 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  25.34 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  25.34 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05080  hypothetical protein  25.08 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  25.34 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>