32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3349 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3349  MSHA biogenesis protein MshJ  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3753  MSHA biogenesis protein MshJ  58.72 
 
 		 218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3665  MSHA biogenesis protein MshJ  58.8 
 
 		 216 aa  260  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3488  MSHA biogenesis protein MshJ  58.33 
 
 		 216 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0482  MSHA biogenesis protein MshJ  56.02 
 
 		 216 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0503  MSHA biogenesis protein MshJ  56.48 
 
 		 216 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3837  MSHA biogenesis protein MshJ  56.48 
 
 		 216 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0506  MSHA biogenesis protein MshJ  56.02 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0464  MSHA biogenesis protein MshJ  59.26 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4419  MSHA biogenesis protein MshJ  52.53 
 
 		 218 aa  236  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0558  MSHA biogenesis protein MshJ  56.02 
 
 		 216 aa  234  8e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3770  MSHA biogenesis protein MshJ  50 
 
 		 218 aa  231  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114  MSHA biogenesis protein MshJ  56.94 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0387  MSHA biogenesis protein MshJ  51.83 
 
 		 218 aa  222  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0542  MSHA biogenesis protein MshJ  51.63 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0452  MSHA biogenesis protein MshJ  45.07 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0168  MSHA biogenesis protein MshJ  29.65 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2818  MSHA biogenesis protein MshJ  33.49 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03700  hypothetical protein  32.24 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002366  MSHA biogenesis protein MshJ  31.16 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0891  hypothetical protein  31.33 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4578  hypothetical protein  29.79 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0467  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHJ)  31.92 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1133  hypothetical protein  28.33 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0346936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0331  MSHA biogenesis protein MshJ  28.05 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00249  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshJ (pilus type IV)  31.78 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0383  MshA biogenesis protein, MshJ-like  34.48 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3094  MshA biogenesis protein, MshJ-like protein  28.76 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3276  MSHA biogenesis protein MshJ  24.86 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0751  hypothetical protein  26.43 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0762  hypothetical protein  25.81 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00540771  normal  0.362126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3334  hypothetical protein  24.2 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>