234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2101 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2101  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1780  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.87 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.736993  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2661  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.3 
 
 		 219 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33351  normal  0.0369922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1534  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.45 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.56665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1972  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.33 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000513659  normal  0.0621528 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.88 
 
 		 215 aa  210  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.33 
 
 		 213 aa  205  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  49.56 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2253  hypothetical protein  48.66 
 
 		 213 aa  201  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.78 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0842  glutathione S-transferase  45.98 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.58 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0347  glutathione S-transferase-like protein  45.69 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.158155  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0878  glutathione S-transferase-like  45.09 
 
 		 239 aa  184  9e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2379  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.25 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0241136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1980  Glutathione S-transferase domain protein  47.81 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000166041  hitchhiker  0.000000103503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2482  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.9 
 
 		 218 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00197657  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1678  glutathione S-transferase-like protein  43.11 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0311729 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2367  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.81 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00131044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.7 
 
 		 223 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1742  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.13 
 
 		 217 aa  178  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2500  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.44 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3105  hypothetical protein  44.74 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3218  glutathione S-transferase-like protein  44.8 
 
 		 194 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3658  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.73 
 
 		 219 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2938  glutathione S-transferase-like  42.19 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1156  glutathione-S-transferase domain-containing protein  42.73 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3219  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.48 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1938  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.88 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3753  putative glutathione S-transferase  41.78 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1555  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.69 
 
 		 197 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2023  glutathione S-transferase family protein  40.36 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.905677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  42.29 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  42.29 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0154  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.56 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1583  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.45 
 
 		 197 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3719  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.91 
 
 		 197 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.626847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1382  glutathione S-transferase  39.11 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253349  normal  0.0983041 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1428  hypothetical protein  38.6 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0774888  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3613  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.55 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  hitchhiker  0.00347188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3641  Glutathione S-transferase domain protein  45.41 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  40.35 
 
 		 555 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2333  glutaredoxin  39.47 
 
 		 223 aa  149  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04766  hypothetical protein  40.27 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05689  hypothetical protein  40.27 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1524  Glutathione S-transferase domain protein  39.04 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4576  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.8 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0297027  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2288  glutathione-S-transferase domain-containing protein  46.45 
 
 		 172 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0541  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.27 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.28 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.17 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  37.82 
 
 		 333 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06911  glutathione S-transferase N terminus  37.23 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0630  glutathione S-transferase  35.24 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0069  glutathione S-transferase N terminus  37.23 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06571  glutathione S-transferase N terminus  33.48 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.737712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.33 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07381  glutathione S-transferase N terminus  30.6 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.360393 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06861  glutathione S-transferase N terminus  33.48 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06961  glutathione S-transferase N terminus  31.88 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.85 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  26.6 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.69 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.26 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  27.89 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  24.22 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.55 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  28 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  25 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  25 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  25 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  25 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  25 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.87 
 
 		 208 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  25 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  25 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  25 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  25 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  25 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  25.11 
 
 		 208 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  25 
 
 		 203 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 203 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  25 
 
 		 203 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 203 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 203 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 203 aa  52  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 203 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10695  glutathione transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11770)  21.9 
 
 		 289 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  24.48 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  24.12 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5011  glutathione S-transferase-like protein  38.24 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.954106 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  25.55 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.55 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  24.48 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.07 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  24.48 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.32 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>