More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1079 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1079  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
260 aa  522  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3926  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.31 
 
 
263 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3859  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  78.08 
 
 
263 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  81.12 
 
 
254 aa  424  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0976  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  75.77 
 
 
271 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3591  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  76.36 
 
 
259 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0647  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  76.36 
 
 
259 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3781  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  75.97 
 
 
259 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.303771  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3658  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  75.58 
 
 
259 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3189  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  76.15 
 
 
259 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0788  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  73.36 
 
 
258 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1899  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.61 
 
 
265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.651881  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0270  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.77 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0805  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.91 
 
 
283 aa  206  4e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1084  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.15 
 
 
281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.19532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.15 
 
 
276 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06045  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.33 
 
 
277 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.11 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.33 
 
 
262 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.02 
 
 
265 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.6 
 
 
276 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2041  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.39 
 
 
319 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.833222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.6 
 
 
265 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.18 
 
 
289 aa  152  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.37 
 
 
261 aa  151  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.62 
 
 
263 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.72 
 
 
272 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0625  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.32 
 
 
261 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.95 
 
 
280 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.62 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.96 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.63 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.63 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.18 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.4 
 
 
281 aa  146  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.91 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.14 
 
 
285 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.46 
 
 
260 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3510  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
265 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.905017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.36 
 
 
282 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0994  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.17 
 
 
285 aa  143  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.101042  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.8 
 
 
279 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.73 
 
 
291 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.07 
 
 
262 aa  142  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.58 
 
 
291 aa  142  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
276 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.08 
 
 
286 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.83 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.62 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.01 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.6 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32 
 
 
271 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.81 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.02 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.76 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.88 
 
 
301 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.76 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.95 
 
 
266 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.69 
 
 
268 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.19 
 
 
296 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.2 
 
 
281 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1112  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.82 
 
 
277 aa  137  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000207078  hitchhiker  0.0000000000000203974 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.19 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.86 
 
 
287 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.19 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.19 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.18 
 
 
270 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.22 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.27 
 
 
300 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.93 
 
 
300 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.42 
 
 
273 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.4 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.08 
 
 
268 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.08 
 
 
268 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.19 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.19 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.19 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.4 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.38 
 
 
257 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.19 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.06 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.23 
 
 
270 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.82 
 
 
274 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2266  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.14 
 
 
310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0523  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.6 
 
 
284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0161876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.82 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.93 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.23 
 
 
270 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.68 
 
 
274 aa  135  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.625021  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.58 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.89 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3632  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.69 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.16 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.6 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2731  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.92 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2649  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.79 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.635632  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.6 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0680  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.15 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>