More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1066 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 539 aa  1124    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2036  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  33.02 
 
 		 541 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2030  amino acid adenylation domain-containing protein  34.78 
 
 		 550 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1182  enterobactin synthetase component F-related protein  34.9 
 
 		 556 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2526  amino acid adenylation domain protein  35.02 
 
 		 535 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0452126 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0131  amino acid adenylation domain-containing protein  34.57 
 
 		 540 aa  253  5.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2771  AMP-binding protein  30.91 
 
 		 597 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2689  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 507 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2774  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 514 aa  232  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149063  decreased coverage  0.000872135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1151  amino acid adenylation domain-containing protein  33.96 
 
 		 496 aa  230  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  31.29 
 
 		 2573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3499  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  32.77 
 
 		 524 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0670  amino acid adenylation domain-containing protein  31.2 
 
 		 517 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0555  amino acid adenylation domain protein  29.89 
 
 		 534 aa  213  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000001061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3052  amino acid adenylation domain-containing protein  37.84 
 
 		 524 aa  212  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  30.11 
 
 		 983 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0542  amino acid adenylation domain protein  28.52 
 
 		 534 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.404103  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  30.2 
 
 		 2273 aa  203  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3984  amino acid adenylation  29.64 
 
 		 1643 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  29.91 
 
 		 3695 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0165  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.27 
 
 		 506 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000579194  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1016  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  39.7 
 
 		 499 aa  201  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.87 
 
 		 1363 aa  200  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  30.11 
 
 		 3374 aa  200  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2568  amino acid adenylation domain-containing protein  29.5 
 
 		 1083 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.403624  hitchhiker  0.0000320919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3195  amino acid adenylation domain-containing protein  28.54 
 
 		 2031 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0687  amino acid adenylation domain-containing protein  30.15 
 
 		 521 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1294  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  29.25 
 
 		 504 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.711083  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  30.92 
 
 		 5926 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  31.94 
 
 		 4101 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1487  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  28.7 
 
 		 504 aa  194  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1530  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  28.7 
 
 		 504 aa  194  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  29.51 
 
 		 1109 aa  193  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  29.83 
 
 		 1525 aa  193  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  29.91 
 
 		 1801 aa  193  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  30.94 
 
 		 4383 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.43 
 
 		 2385 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  31.16 
 
 		 4747 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1461  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  28.34 
 
 		 504 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.68 
 
 		 2385 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1259  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  28.34 
 
 		 504 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  30.19 
 
 		 7310 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  29.96 
 
 		 4882 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.49 
 
 		 2385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  29.2 
 
 		 5422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.43 
 
 		 2385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  29.48 
 
 		 5953 aa  191  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1287  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  28.88 
 
 		 503 aa  191  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1261  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  28.34 
 
 		 504 aa  191  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242821  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  29.27 
 
 		 1483 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  29.27 
 
 		 1483 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1389  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  28.88 
 
 		 503 aa  191  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  31.25 
 
 		 2606 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  29.27 
 
 		 1528 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  29.27 
 
 		 1520 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  30.06 
 
 		 6889 aa  189  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3972  non-ribosomal peptide synthetase  34.22 
 
 		 1368 aa  189  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1424  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  28.34 
 
 		 504 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5328  amino acid adenylation domain-containing protein  35.31 
 
 		 1351 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3920  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  29.06 
 
 		 504 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  25.66 
 
 		 2439 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5851  amino acid adenylation domain protein  34.79 
 
 		 1343 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877772  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  29.06 
 
 		 1776 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4340  non-ribosomal peptide synthetase  33.95 
 
 		 1360 aa  189  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34953  normal  0.731167 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  28.52 
 
 		 3291 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  28.35 
 
 		 2156 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1092  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  27.79 
 
 		 504 aa  187  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  28.81 
 
 		 6404 aa  187  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  29.49 
 
 		 1833 aa  186  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.09 
 
 		 4531 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.55 
 
 		 2385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.92 
 
 		 1806 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  29.17 
 
 		 2385 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.55 
 
 		 2385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29 
 
 		 4968 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  30.04 
 
 		 5213 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  28.52 
 
 		 3348 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  28.71 
 
 		 6676 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  29.42 
 
 		 1074 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  29.58 
 
 		 3470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  29.73 
 
 		 2867 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  27.81 
 
 		 2581 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  29.14 
 
 		 1336 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  30.29 
 
 		 1779 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  29.06 
 
 		 9175 aa  183  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5011  amino acid adenylation:thioester reductase  30.09 
 
 		 1148 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  28.63 
 
 		 5929 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  29.25 
 
 		 2386 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  29.17 
 
 		 2164 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  27.66 
 
 		 1193 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  27.27 
 
 		 541 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20090  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  26.13 
 
 		 1344 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0150684  normal  0.025182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  27.85 
 
 		 1193 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4452  non-ribosomal peptide synthetase  33.88 
 
 		 1395 aa  182  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270452  normal  0.260871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  28.79 
 
 		 1130 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  28.52 
 
 		 6006 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  27.39 
 
 		 2156 aa  181  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  27.43 
 
 		 1282 aa  181  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  30.28 
 
 		 2791 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  28.68 
 
 		 6202 aa  180  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>