81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0878 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  49.06 
 
 
159 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243981  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  48.75 
 
 
170 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  50.62 
 
 
160 aa  157  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0982509  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1019  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
161 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.127831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  45.73 
 
 
164 aa  153  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0801  acetyltransferase  47.1 
 
 
159 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2820  GCN5-related N-acetyltransferase  45.62 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.513775  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  45.34 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  45.62 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.622021  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2903  GCN5-related N-acetyltransferase  45.62 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3113  GCN5-related N-acetyltransferase  45.96 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280969  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1374  acetyltransferase  45.62 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  45.96 
 
 
165 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1263  GCN5-related N-acetyltransferase  45.96 
 
 
165 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159893  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3256  GCN5-related N-acetyltransferase  45.96 
 
 
165 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.565106  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 
170 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.495636  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2393  hypothetical protein  34.78 
 
 
173 aa  88.2  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1533  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
165 aa  87.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.690622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3220  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_004310  BR1684  acetyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.752549  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1132  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1628  acetyltransferase  32.58 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.451635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4076  GCN5-related N-acetyltransferase  36.94 
 
 
166 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0930911  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3428  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
166 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.455281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6014  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2467  GCN5-related N-acetyltransferase  38.13 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0251187  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7372  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01736  hypothetical protein  34.31 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4729  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.346407  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 
158 aa  72  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00743  conserved hypothetical protein  29.17 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00511471  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0953221  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2294  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2236  GCN5-related N-acetyltransferase  31.74 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0256  GCN5-related N-acetyltransferase  40.29 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.113232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3124  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361691  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3426  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
171 aa  54.7  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0625  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
195 aa  54.3  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5712  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
142 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1021  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
143 aa  48.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0567857  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4410  GCN5-related N-acetyltransferase  39.68 
 
 
162 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1348  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4090  GCN5-related N-acetyltransferase  39.68 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171947  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1365  putative acetyltransferase  26.71 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2388  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557718  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  43.1 
 
 
148 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
136 aa  45.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535173  normal  0.634598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1545  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 
136 aa  44.7  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3143  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
143 aa  44.7  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.249751  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1950  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0190809  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3134  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703967  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1693  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
139 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2649  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0902  acetyltransferase  36.21 
 
 
298 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  24.34 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.57 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6566  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 
142 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 
163 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  27.97 
 
 
157 aa  42.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9151  N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferase-like protein  34.18 
 
 
195 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3124  acetyltransferase, GNAT family  23.45 
 
 
163 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  24.65 
 
 
169 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
136 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398514  normal  0.140631 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
142 aa  41.6  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.124744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0518  GCN5-related N-acetyltransferase  27.19 
 
 
176 aa  41.6  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1979  acetyltransferase, GNAT family  30.56 
 
 
147 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.306431  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1771  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  21.49 
 
 
173 aa  41.2  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2108  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
148 aa  41.2  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1679  acetyltransferase  30.56 
 
 
147 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00221151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>