53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3220 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3220  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 171 aa  343  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2467  GCN5-related N-acetyltransferase  59.39 
 
 		 166 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0251187  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7372  GCN5-related N-acetyltransferase  53.7 
 
 		 167 aa  187  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  63.92 
 
 		 165 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.346407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2236  GCN5-related N-acetyltransferase  62.26 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2393  hypothetical protein  55.83 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  49.39 
 
 		 169 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1628  acetyltransferase  48.78 
 
 		 169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.451635  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  53.33 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.752549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1684  acetyltransferase  48.17 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2294  GCN5-related N-acetyltransferase  51.22 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  53.66 
 
 		 171 aa  141  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00743  conserved hypothetical protein  46.84 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00511471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  45.81 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1132  GCN5-related N-acetyltransferase  49.08 
 
 		 174 aa  134  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0256  GCN5-related N-acetyltransferase  44.85 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  37.34 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0801  acetyltransferase  37.74 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.622021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2820  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.513775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243981  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2903  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 		 164 aa  94.7  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3256  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.565106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1263  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159893  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3113  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280969  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1374  acetyltransferase  34.81 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  38.52 
 
 		 160 aa  92  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0982509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1019  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 		 161 aa  91.7  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.127831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1533  GCN5-related N-acetyltransferase  40.61 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.690622  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 		 183 aa  85.5  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  35.85 
 
 		 169 aa  85.1  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.495636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0930911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3124  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4729  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4076  GCN5-related N-acetyltransferase  37.11 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3428  GCN5-related N-acetyltransferase  35.85 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.455281  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3426  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6014  GCN5-related N-acetyltransferase  33.89 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01736  hypothetical protein  37.41 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  38.13 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0953221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.113232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1520  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1021  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0567857  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2108  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 148 aa  42  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 		 142 aa  41.6  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.124744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 		 133 aa  41.2  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00104709  normal  0.101966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1348  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>