53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2393 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2393  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  350  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2467  GCN5-related N-acetyltransferase  56.36 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0251187  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3220  GCN5-related N-acetyltransferase  55.83 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7372  GCN5-related N-acetyltransferase  48.45 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  56.52 
 
 		 165 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.346407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  51.53 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.752549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  49.06 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1628  acetyltransferase  47.56 
 
 		 169 aa  150  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.451635  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1684  acetyltransferase  47.56 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2236  GCN5-related N-acetyltransferase  52.44 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2294  GCN5-related N-acetyltransferase  47.93 
 
 		 176 aa  144  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  46.2 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1132  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 		 174 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00743  conserved hypothetical protein  40.25 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00511471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0256  GCN5-related N-acetyltransferase  42.51 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1019  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.127831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 		 164 aa  91.3  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.622021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  35.26 
 
 		 160 aa  90.9  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0982509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3256  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.565106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2820  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.513775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3113  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1263  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159893  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2903  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  43.04 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0930911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 		 183 aa  88.2  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1374  acetyltransferase  35.9 
 
 		 171 aa  88.2  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 170 aa  88.2  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1533  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.690622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0801  acetyltransferase  34.62 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  34.36 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.495636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3124  GCN5-related N-acetyltransferase  31.98 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  35.98 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0953221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3426  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6014  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4076  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3428  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.455281  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4729  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01736  hypothetical protein  36 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.113232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0625  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3134  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703967  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000199537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3360  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0896  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50776  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1021  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0567857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>