80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0930 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
164 aa  339  8e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  45.73 
 
 
170 aa  157  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1019  GCN5-related N-acetyltransferase  46.34 
 
 
161 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.127831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  46.01 
 
 
159 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  45.12 
 
 
160 aa  155  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0982509  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  45.73 
 
 
183 aa  153  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  47.8 
 
 
163 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3256  GCN5-related N-acetyltransferase  47.17 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.565106  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  47.17 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1263  GCN5-related N-acetyltransferase  47.17 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159893  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3113  GCN5-related N-acetyltransferase  46.54 
 
 
165 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280969  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2903  GCN5-related N-acetyltransferase  45.12 
 
 
164 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  44.51 
 
 
164 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.622021  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2820  GCN5-related N-acetyltransferase  44.51 
 
 
164 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.513775  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1374  acetyltransferase  43.9 
 
 
171 aa  140  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0801  acetyltransferase  42.33 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  39.46 
 
 
170 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.495636  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3220  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
171 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_003296  RS01736  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3428  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.455281  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
170 aa  87.8  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.113232 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
170 aa  87.8  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361691  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1533  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 
165 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.690622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2236  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
180 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4076  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  84  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.346407  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1132  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2467  GCN5-related N-acetyltransferase  32.3 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0251187  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3124  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6014  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
192 aa  77.4  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  25.75 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.752549  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2393  hypothetical protein  29.01 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4729  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2294  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1684  acetyltransferase  25.32 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7372  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1628  acetyltransferase  25.32 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.451635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00743  conserved hypothetical protein  27.67 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00511471  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0256  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
168 aa  60.8  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0930911  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3426  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0953221  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 
186 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  24.65 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1367  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  30 
 
 
727 aa  45.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.704732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4326  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3698  GCN5-related N-acetyltransferase  23.65 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05881  putative acetyltransferase  36.07 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1950  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 
207 aa  44.3  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0190809  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 
136 aa  43.9  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535173  normal  0.634598 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2093  acetyltransferase  28.57 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0952  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  27.4 
 
 
770 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0091  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  25.83 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  27.4 
 
 
365 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2602  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229806  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0876  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.52 
 
 
221 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0191  GCN5-related N-acetyltransferase  26.98 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  20.92 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0257  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  31.94 
 
 
726 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1365  putative acetyltransferase  22.31 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0562  putative acetyltransferase  31.15 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.48816  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0231  putative acetyltransferase  26.75 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.329835 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06181  putative acetyltransferase  31.15 
 
 
176 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.7663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1906  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.537884  hitchhiker  0.0000285957 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1885  acetyltransferase  27.68 
 
 
176 aa  42  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7249  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6154  GCN5-related N-acetyltransferase  27.47 
 
 
146 aa  41.2  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229452  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  26.71 
 
 
365 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2795  acetyltransferase  35.06 
 
 
178 aa  41.2  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3958  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
165 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230321  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1545  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
136 aa  40.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06261  putative acetyltransferase  32.79 
 
 
176 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.226546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>