200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1906 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1906  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
137 aa  287  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.537884  hitchhiker  0.0000285957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1637  acetyltransferase  61.94 
 
 
140 aa  174  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.240715  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4885  acetyltransferase  56.25 
 
 
141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2636  GCN5-related N-acetyltransferase  51.59 
 
 
137 aa  140  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0543  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.41 
 
 
139 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4783  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.62 
 
 
139 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000302728  hitchhiker  0.00000145166 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1794  GCN5-related N-acetyltransferase  39.06 
 
 
139 aa  103  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000157192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1817  GCN5-related N-acetyltransferase  36.3 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0569888  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0670  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
137 aa  92.8  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4024  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 
136 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171861  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2400  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380726  normal  0.576848 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1976  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03206  hypothetical protein  30.77 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2395  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.935665  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2441  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  35.34 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0987  GCN5-related N-acetyltransferase  37.4 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1009  GCN5-related N-acetyltransferase  36.89 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5277  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
277 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1021  GCN5-related N-acetyltransferase  37.4 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.457059  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  37.4 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0638  GCN5-related N-acetyltransferase  31.5 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516008  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1963  acetyltransferase  29.13 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3298  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1072  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4800  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0178768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12990  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.69 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2108  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2132  GCN5-related protein N-acetyltransferase  29.03 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19970  acetyltransferase  29.66 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.310299  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1193  acetyltransferase  31.36 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0123933  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1348  GCN5-related N-acetyltransferase  32.23 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0773  hypothetical protein  31.93 
 
 
201 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.208077  normal  0.373974 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0550  acetyltransferase, GNAT family  33.93 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000998948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  28.18 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13460  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0422  hypothetical protein  33.66 
 
 
111 aa  60.1  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0807982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1021  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0567857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1379  acetyltransferase  34.15 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000349378  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  38.2 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171947  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2217  GCN5-related N-acetyltransferase  24.62 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.175787  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3328  acetyltransferase  24.82 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06181  putative acetyltransferase  32.26 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.7663  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002775  hypothetical protein  34.21 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.888524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3143  GCN5-related N-acetyltransferase  28.23 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.249751  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05651  putative acetyltransferase  34.75 
 
 
182 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0562  putative acetyltransferase  31.45 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.48816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2240  acetyltransferase  26.81 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.687637  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1892  acetyltransferase  32.2 
 
 
180 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2404  acetyltransferase  26.81 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.747121  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06261  putative acetyltransferase  31.09 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.226546  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06171  putative acetyltransferase  32.2 
 
 
180 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.856364  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0740  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.124744 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08251  putative acetyltransferase  31.93 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05881  putative acetyltransferase  30.77 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2174  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.09 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000188257  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0882  acetyltransferase  32.17 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2421  acetyltransferase, GNAT family  26.09 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1392  GCN5-related N-acetyltransferase  32.46 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182115  normal  0.0388406 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2160  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.09 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134632  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06411  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00870)  33.75 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355701  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1693  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1100  acetyltransferase  30.38 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2439  acetyltransferase  24.82 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129008  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4121  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0969  acetyltransferase  31.3 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2240  hypothetical protein  26.26 
 
 
176 aa  51.6  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0216182  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3488  hypothetical protein  29.9 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0164567  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01210  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.65 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1451  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1189  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0597607  normal  0.666757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2483  GCN5-related N-acetyltransferase  26.77 
 
 
137 aa  50.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3134  GCN5-related N-acetyltransferase  28.83 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703967  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17681  GNAT family acetyltransferase  27.84 
 
 
153 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4823  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4973  GCN5-like N-acetyltransferase  27.05 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000872655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2371  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.96 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1733  GNAT family acetyltransferase  28.87 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.804122  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1756  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.04 
 
 
213 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.896774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  26.89 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.60586  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22360  GCN5-related N-acetyltransferase protein  30.09 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2961  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.13 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2504  acetyltransferase, GNAT family  23.13 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265344  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2669  GCN5-related N-acetyltransferase  21.83 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00197805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3046  GCN5-related N-acetyltransferase  25.44 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_7981  predicted protein  25.42 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699216  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0461  putative acetyltransferase  29.46 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5258  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  26.23 
 
 
183 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0373782  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0846  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  30.84 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0440929 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3028  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
175 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3092  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
175 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2612  acetyltransferase  29.33 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0440411  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3498  GCN5-related N-acetyltransferase  22.22 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.91187  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2802  acetyltransferase  29.33 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.613256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>