34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3328 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3328  acetyltransferase  100 
 
 		 152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1286  acetyltransferase  78.43 
 
 		 154 aa  257  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000493773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1215  acetyltransferase  76.16 
 
 		 152 aa  253  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.265944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1216  acetyltransferase  74.34 
 
 		 152 aa  251  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.709747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2669  GCN5-related N-acetyltransferase  67.76 
 
 		 152 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00197805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3003  GCN5-related N-acetyltransferase  58.49 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3161  GCN5-related N-acetyltransferase  58.49 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.248512  hitchhiker  0.00612614 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1360  GCN5-related N-acetyltransferase  58.49 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3018  GCN5-related N-acetyltransferase  58.49 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1637  acetyltransferase  27.01 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.240715  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2636  GCN5-related N-acetyltransferase  26.43 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 		 317 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1906  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.537884  hitchhiker  0.0000285957 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0670  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4885  acetyltransferase  25 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1021  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.457059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12990  acetyltransferase (GNAT) family protein  25.36 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0987  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1009  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0543  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19970  acetyltransferase  27.27 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.310299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1794  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000157192  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2400  GCN5-related N-acetyltransferase  25.56 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380726  normal  0.576848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1189  GCN5-related N-acetyltransferase  29.77 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0597607  normal  0.666757 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1817  GCN5-related N-acetyltransferase  26.51 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0569888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4783  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.22 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000302728  hitchhiker  0.00000145166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2132  GCN5-related protein N-acetyltransferase  27.69 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1072  GCN5-related N-acetyltransferase  25.76 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03206  hypothetical protein  29.82 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0638  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516008  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06411  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00870)  26.71 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4800  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0178768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>