49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2236 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_2236  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
180 aa  362  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2467  GCN5-related N-acetyltransferase  69.18 
 
 
166 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0251187  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3220  GCN5-related N-acetyltransferase  62.26 
 
 
171 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  60.49 
 
 
165 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.346407  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7372  GCN5-related N-acetyltransferase  51.55 
 
 
167 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2393  hypothetical protein  52.44 
 
 
173 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  46.11 
 
 
177 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.752549  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  48.43 
 
 
169 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1684  acetyltransferase  47.8 
 
 
169 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1628  acetyltransferase  47.8 
 
 
169 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.451635  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  45.22 
 
 
158 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2294  GCN5-related N-acetyltransferase  47.31 
 
 
176 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1132  GCN5-related N-acetyltransferase  46.93 
 
 
174 aa  138  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00743  conserved hypothetical protein  44.1 
 
 
173 aa  124  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00511471  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  51.75 
 
 
171 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
170 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  34.36 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0256  GCN5-related N-acetyltransferase  41.57 
 
 
168 aa  97.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1019  GCN5-related N-acetyltransferase  34.36 
 
 
161 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.127831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  38.69 
 
 
160 aa  94.4  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0982509  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1533  GCN5-related N-acetyltransferase  37.27 
 
 
165 aa  92.8  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.690622  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1374  acetyltransferase  33.95 
 
 
171 aa  87  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0801  acetyltransferase  33.74 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.622021  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2903  GCN5-related N-acetyltransferase  32.3 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2820  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.513775  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
163 aa  85.1  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0930911  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1263  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159893  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3256  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.565106  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3113  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280969  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  31.74 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4076  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4729  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3428  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.455281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.495636  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3124  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3426  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
171 aa  60.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6014  GCN5-related N-acetyltransferase  33.13 
 
 
192 aa  60.8  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 
159 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0953221  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361691  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.113232 
 
 
-
 
NC_003296  RS01736  hypothetical protein  34.53 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_7294  predicted protein  30.13 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00181231  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_7293  predicted protein  30.13 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110578  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3275  GCN5-related N-acetyltransferase  38.55 
 
 
217 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0761578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>