77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3275 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3275  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
217 aa  425  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0761578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  45.08 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0742663  normal  0.331805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0958  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
208 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0531  GCN5-related protein N-acetyltransferase  39.81 
 
 
208 aa  138  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101247  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1160  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
202 aa  129  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.719093  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02530  acetyltransferase  42.71 
 
 
221 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  44.33 
 
 
223 aa  125  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0226769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5497  GCN5-related N-acetyltransferase  38.34 
 
 
214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000151492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4707  GCN5-related N-acetyltransferase  38.83 
 
 
203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0617246  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1790  GCN5-related N-acetyltransferase  39.91 
 
 
231 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242813  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0302  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 
226 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00317404  normal  0.0799447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0622  GCN5-related N-acetyltransferase  33.16 
 
 
210 aa  99  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1217  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1305  GCN5-related N-acetyltransferase  31.12 
 
 
204 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4638  GCN5-related N-acetyltransferase  40.49 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0813  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7218  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1027  GCN5-related N-acetyltransferase  32.4 
 
 
208 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.406805  normal  0.416971 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 
219 aa  61.6  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2791  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0245  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.57 
 
 
149 aa  55.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35760  hypothetical protein  43.75 
 
 
154 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.28006e-16  decreased coverage  1.5308899999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.62 
 
 
160 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3064  putative acetyltransferase  41.67 
 
 
131 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  47.46 
 
 
147 aa  48.5  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
169 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  47.69 
 
 
237 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3716  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.66 
 
 
151 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0086441  hitchhiker  0.00862742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
181 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157687  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
381 aa  45.4  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4431  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
160 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
167 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
169 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4376  GCN5-related N-acetyltransferase  43.48 
 
 
145 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.246785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1368  acyltransferase protein  40.62 
 
 
177 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427933  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1114  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.21 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46 
 
 
160 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 
148 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2814  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
181 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  44.62 
 
 
145 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.63662 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4517  hypothetical protein  41.54 
 
 
145 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0536703  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0008  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  32.84 
 
 
160 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  43.1 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.18 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  40.38 
 
 
139 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3230  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.81 
 
 
162 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3283  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.62 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.33549  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03213  acetyltransferase  32.98 
 
 
176 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3461  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.62 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3325  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.62 
 
 
182 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3199  GCN5-related N-acetyltransferase  46.81 
 
 
154 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 
147 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
174 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02191  hypothetical protein  30.93 
 
 
196 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1160  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.25 
 
 
162 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1084  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.62 
 
 
191 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0126129  hitchhiker  0.000306087 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4590  hypothetical protein  41.54 
 
 
145 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.94 
 
 
153 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.5 
 
 
153 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
168 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4514  hypothetical protein  41.54 
 
 
145 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0553  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40.62 
 
 
161 aa  42.4  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.927213  hitchhiker  0.000465123 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4392  hypothetical protein  41.54 
 
 
145 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.72967  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4427  hypothetical protein  41.54 
 
 
145 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.499385  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2315  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
168 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
153 aa  41.6  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
158 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.806577 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.57 
 
 
175 aa  41.6  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4246  hypothetical protein  31.25 
 
 
147 aa  41.6  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4554  hypothetical protein  31.25 
 
 
147 aa  41.6  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.321988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2256  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.81 
 
 
148 aa  41.6  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3901  acetyltransferase  40 
 
 
143 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0744234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4103  GCN5-related N-acetyltransferase  44.9 
 
 
291 aa  41.6  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
339 aa  41.6  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.163048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>