52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_02530  acetyltransferase  100 
 
 
221 aa  440  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0531  GCN5-related protein N-acetyltransferase  47.29 
 
 
208 aa  178  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101247  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  44.17 
 
 
201 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0742663  normal  0.331805 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0302  GCN5-related N-acetyltransferase  42.25 
 
 
226 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00317404  normal  0.0799447 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1160  GCN5-related N-acetyltransferase  49.28 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.719093  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1217  GCN5-related N-acetyltransferase  45.26 
 
 
204 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5497  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
214 aa  144  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000151492  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0958  GCN5-related N-acetyltransferase  44.27 
 
 
208 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1305  GCN5-related N-acetyltransferase  44.92 
 
 
204 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4707  GCN5-related N-acetyltransferase  46.52 
 
 
203 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0617246  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  47.26 
 
 
223 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0226769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1790  GCN5-related N-acetyltransferase  42.79 
 
 
231 aa  131  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0622  GCN5-related N-acetyltransferase  39.36 
 
 
210 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3275  GCN5-related N-acetyltransferase  42.71 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0761578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0813  GCN5-related N-acetyltransferase  34.74 
 
 
210 aa  99  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4638  GCN5-related N-acetyltransferase  31.5 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7218  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  31.44 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1027  GCN5-related N-acetyltransferase  31.09 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.406805  normal  0.416971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1096  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
171 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1576  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
171 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1553  GCN5-related N-acetyltransferase  44.83 
 
 
171 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158841  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0245  GCN5-related N-acetyltransferase  30.96 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4712  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
171 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  38.55 
 
 
172 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  46.55 
 
 
172 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2466  GCN5-related N-acetyltransferase  45.61 
 
 
143 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0154412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2791  GCN5-related N-acetyltransferase  31.09 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524261  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1763  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.23 
 
 
138 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2741  GCN5-related N-acetyltransferase  41.94 
 
 
181 aa  45.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432705  normal  0.0282239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  31.9 
 
 
547 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2006  GCN5-related N-acetyltransferase  38 
 
 
166 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135971  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 
180 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
151 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1307  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2537  tRNA (guanine-N1)-methyltransferase  38.33 
 
 
464 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.106194  normal  0.161269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2338  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
177 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174627  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22280  acetyltransferase  32.67 
 
 
186 aa  43.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0486  GCN5-related N-acetyltransferase  42 
 
 
270 aa  42.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1715  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.06 
 
 
168 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2471  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 
173 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.583315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
158 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.806577 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3505  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.89 
 
 
147 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05420  conserved hypothetical protein  36 
 
 
844 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175424  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2667  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
178 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.065079  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3634  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.89 
 
 
147 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11190  sortase-like acyltransferase  33.94 
 
 
171 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0130683  normal  0.626288 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 
156 aa  42.4  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2172  GCN5-related N-acetyltransferase  27.56 
 
 
166 aa  42  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0838  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.75 
 
 
103 aa  42  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0363  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
175 aa  41.6  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791622  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3447  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.1 
 
 
147 aa  41.6  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>