52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01736 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01736  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  344  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  70.41 
 
 		 170 aa  225  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  70.41 
 
 		 170 aa  225  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.113232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3124  GCN5-related N-acetyltransferase  46.59 
 
 		 179 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  49.7 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 		 170 aa  97.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.495636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 		 163 aa  95.1  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 164 aa  94.7  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.622021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2903  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1019  GCN5-related N-acetyltransferase  39.42 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.127831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1374  acetyltransferase  33.33 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2820  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.513775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1533  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 		 165 aa  91.3  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.690622  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1263  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159893  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3256  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.565106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3113  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280969  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0801  acetyltransferase  33.74 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243981  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4076  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4729  GCN5-related N-acetyltransferase  39.52 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0982509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  31.1 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6014  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3428  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.455281  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.346407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.752549  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00743  conserved hypothetical protein  32.12 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00511471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1132  GCN5-related N-acetyltransferase  35.26 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3220  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  37.89 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0930911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2294  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1684  acetyltransferase  27.78 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2393  hypothetical protein  35.2 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1628  acetyltransferase  27.16 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.451635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0953221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7372  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2467  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0251187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3426  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0035  acetyltransferase  22.36 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00435324  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2236  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 		 180 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535173  normal  0.634598 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0488  acetyltransferase, GNAT family protein  29.27 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0236  GCN5-related N-acetyltransferase  40.3 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2871  GCN5-related N-acetyltransferase  40.3 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2214  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 		 167 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16600  N-acetylglutamate synthase  24.49 
 
 		 155 aa  40.8  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>